RNA–Protein interactions for RNA: YJR104C

SOD1, Transcript of Cytosolic copper-zinc superoxide dismutase, yeast

Gene SOD1, Length 465 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOD1	YJR104C	SLZ1	P40167	298 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	LAS21	P40367	830 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ATM1	P40416	690 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PKP1	P40530	394 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PFA3	P42836	336 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	GAT1	P43574	510 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MCM22	P47167	239 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PKP2	P53170	491 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YGR017W	P53210	297 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YGR042W	P53227	271 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	GND2	P53319	492 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	IGO1	P53897	168 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SWS2	P53937	143 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	TIM8	P57744	87 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ODC1	Q03028	310 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CDC123	Q05791	360 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YLR345W	Q06137	509 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	TMA10	Q06177	86 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YLR413W	Q06689	675 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CYK3	Q07533	885 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YOL019W	Q08157	551 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	GIS3	Q12418	502 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SFG1	Q12507	346 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	COA6	Q3E846	104 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ATP5	P09457	212 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	FUN14	P18411	198 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SEC59	P20048	519 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	UTR1	P21373	530 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CPR4	P25334	318 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ATG15	P25641	520 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	AHC2	P25649	128 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MTC2	P34246	357 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MRPL4	P36517	319 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YBL029W	P38201	376 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	UBA4	P38820	440 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	GAA1	P39012	614 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PRM9	P39551	298 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	KHA1	P40309	873 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MND2	P40577	368 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	LCB2	P40970	561 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	BAP3	P41815	604 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	GLC8	P41818	229 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YFL054C	P43549	646 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ATG18	P43601	500 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CHA4	P43634	648 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SNG1	P46950	547 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PHO86	P46956	311 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	LOH1	P47055	219 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	VPS25	P47142	202 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	HXT16	P47185	567 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	COQ5	P49017	307 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ROG1	P53118	685 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YNL181W	P53878	407 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MRP51	Q02950	344 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MSC1	Q03104	513 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	TRS31	Q03337	283 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	NHX1	Q04121	633 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RIF2	Q06208	395 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	FRQ1	Q06389	190 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CUR1	Q06469	252 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SSK1	Q07084	712 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RFU1	Q08003	200 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YOL131W	Q08270	108 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MED7	Q08278	222 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CSM4	Q08955	156 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	NDJ1	Q12366	352 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YOP1	Q12402	180 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	SKS1	Q12505	502 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	MHF2	Q3E829	80 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	CKA1	P15790	372 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	ERD1	P16151	362 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PDX1	P16451	410 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	RHB1	P25378	209 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	YCR102C	P25608	368 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	LAC1	P28496	418 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.28	□□□□□ -1.88	not detected
SOD1	YJR104C	AIM26	P32858	118 aa		3.28	□□□□□ -1.88
SOD1	YJR104C	REC104	P33323	182 aa		3.28	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 86.4 ms