RNA–Protein interactions for RNA: YJL013C

MAD3, Transcript of Subunit of spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD3, Length 1,548 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD3	YJL013C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	NUP2	P32499	720 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SRB4	P32569	687 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YBL059W	P34224	193 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MCH2	P36032	473 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	AIM23	P47015	356 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CRH1	P53301	507 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TAF10	Q12030	206 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ERV2	Q12284	196 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PMT2	P31382	759 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PEX22	P39718	180 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	GDS1	P41913	522 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	BIR1	P47134	954 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MRPL50	P53724	139 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MFG1	Q07684	458 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PAM18	Q07914	168 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SDO1	Q07953	250 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ATP16	Q12165	160 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	IZH2	Q12442	317 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PRM4	Q12498	284 aa		4.26	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	VPS3	P23643	1011 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	INO2	P26798	304 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	LDS1	P31379	325 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	KRE6	P32486	720 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PDC2	P32896	925 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CYM1	P32898	989 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YPT53	P36019	220 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YPC1	P38298	316 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MSS2	P40990	351 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	BNS1	P50084	137 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	UBC13	P52490	153 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	OST6	Q03723	332 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.25	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PRB1	P09232	635 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CBS2	P14905	389 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CPR3	P25719	182 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	URA10	P30402	227 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PAN6	P40459	309 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TAD2	P47058	250 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TIS11	P47977	285 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SLT2	Q00772	484 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	VBA1	Q04301	562 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	IRC25	Q07951	179 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SFM1	Q12314	213 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		4.24	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TFS1	P14306	219 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	GIT1	P25346	518 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ZIP1	P31111	875 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	DEP1	P31385	405 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CSE1	P33307	960 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	HEM14	P40012	539 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ATG18	P43601	500 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MCT1	Q12283	360 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TFC7	Q12415	435 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.23	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ARG80	P07249	177 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	REE1	P40893	198 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CGR1	P53188	120 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PGA2	P53903	129 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	NDD1	Q08887	554 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MHP1	P43638	1398 aa		4.22	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MRPL6	P32904	214 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.21	□□□□□ -1.73	not detected
MAD3	YJL013C	FMP46	P36141	133 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	DDI1	P40087	428 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	OTU1	P43558	301 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	VHT1	P53241	593 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	VAC7	P53950	1165 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YML122C	Q03207	126 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	YLR446W	Q06204	433 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	MSH5	Q12175	901 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	GIS3	Q12418	502 aa		4.21	□□□□□ -1.73
MAD3	YJL013C	SAC3	P46674	1301 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	KRE9	P39005	276 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	YER186C	P40101	306 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	YGL260W	P53056	76 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	FAR10	Q06001	478 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	TAZ1	Q06510	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74
MAD3	YJL013C	RSA1	Q08932	381 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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