RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	FLP1	P03870	423 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PDE2	P06776	526 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YCL002C	P25565	263 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	FUN26	P31381	517 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SDS22	P36047	338 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PAU24	P38155	120 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	ALG3	P38179	458 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SAM37	P50110	327 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RSM28	Q03430	361 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	BUR2	Q05949	395 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MCP1	Q12106	302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PMT2	P31382	759 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	DOA4	P32571	926 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	VPS17	P32913	551 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	THI2	P38141	450 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MAL32	P38158	584 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HXT9	P40885	567 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	TPN1	P53099	579 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MAL12	P53341	584 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HXT11	P54862	567 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YPL199C	Q08954	240 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YPR1	Q12458	312 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MEC1	P38111	2368 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YBR056W-A	I2HB52	66 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HOM3	P10869	527 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	NUP1	P20676	1076 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SLC1	P33333	303 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.75	□□□□□ -0.21	not detected
RTC3	YHR087W	SHR5	P41912	237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	IRC6	P43615	237 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MSS11	Q03825	758 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YOL036W	Q08206	761 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	COX9	P07255	59 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MLH1	P38920	769 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SDP1	P40479	209 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SFH5	P47008	294 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PMT5	P52867	743 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MRPL35	Q06678	367 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	COQ10	Q08058	207 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	GUP2	Q08929	609 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	LST4	P34239	828 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YBR137W	P38276	179 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PMT6	P42934	759 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PPT1	P53043	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MRPL1	Q04599	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	TAZ1	Q06510	381 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	ENB1	Q08299	606 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YOS9	Q99220	542 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	HO	P09932	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	STE12	P13574	688 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	DBF2	P22204	572 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	SPG5	P42933	373 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RPE1	P46969	238 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	ASK10	P48361	1146 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	CYK3	Q07533	885 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	CYT1	P07143	309 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	CWH43	P25618	953 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	CHK1	P38147	527 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	PHO90	P39535	881 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YER184C	P39961	794 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	LCL3	P53153	274 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	NUP116	Q02630	1113 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RSM10	Q03201	203 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	EKI1	Q03764	534 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YPR196W	Q06595	470 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	YOL073C	Q08232	322 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	RLM1	Q12224	676 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RTC3	YHR087W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	CDC26	P14724	124 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.7	□□□□□ -0.22	not detected
RTC3	YHR087W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	YKE4	P40544	346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	VNX1	P42839	908 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	BNA6	P43619	295 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	ERV29	P53337	310 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	HLR1	Q04429	423 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	PHO92	Q06390	306 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RTC3	YHR087W	TPO3	Q06451	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.5 ms