RNA–Protein interactions for RNA: YBR049C

REB1, Transcript of RNA polymerase I enhancer binding protein, yeast

Gene REB1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REB1	YBR049C	MRPL4	P36517	319 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	WSC4	P38739	605 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SER33	P40510	469 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YFR057W	P43625	151 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SFH5	P47008	294 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SBH2	P52871	88 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	COS1	P53822	381 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ALE1	Q08548	619 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	GEP3	Q08622	556 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RLM1	Q12224	676 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	EFG1	Q3E705	233 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	MGR1	P25573	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ACH1	P32316	526 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	HYM1	P32464	399 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	OAR1	P35731	278 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	JEN1	P36035	616 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RIB5	P38145	238 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	LDB7	P38210	180 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ASG7	P46993	209 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YJL118W	P47022	219 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	AVT1	P47082	602 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PHB2	P50085	310 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YGR017W	P53210	297 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	NRK1	P53915	240 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	TRM82	Q03774	444 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	APC4	Q04601	652 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	DPP1	Q05521	289 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	BUR2	Q05949	395 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SFH1	Q06168	426 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PEX30	Q06169	523 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	HRD1	Q08109	551 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RGT2	Q12300	763 aa		3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SAG1	P20840	650 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PHD1	P36093	366 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	MRPL15	P36523	253 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	POP4	P38336	279 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	VMA7	P39111	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ERV46	P39727	415 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RFC2	P40348	353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	COG5	P53951	403 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YLR460C	P54007	376 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YPL077C	Q02831	240 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	FCY22	Q12119	530 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	HRT3	Q12347	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	STE18	P18852	110 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ELO1	P39540	310 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	OXA1	P39952	402 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SHO1	P40073	367 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	COA1	P40452	197 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YIL067C	P40514	678 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YGR210C	P42942	411 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YFR020W	P43600	232 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SOL1	P50278	321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	FMP48	P53233	369 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YNR062C	P53748	327 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	TPO3	Q06451	622 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RRD2	Q12461	358 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.35	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PSK1	P31374	1356 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RFA3	P26755	122 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SHP1	P34223	423 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPC25	P35718	212 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	FLO10	P36170	1169 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	BNA4	P38169	460 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PFF1	P38244	976 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PCA1	P38360	1216 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	SRP14	P38985	146 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	PGD1	P40356	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	GUF1	P46943	645 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	AIM22	P47051	409 aa		3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
REB1	YBR049C	BIR1	P47134	954 aa		3.34	□□□□□ -1.87

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