RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000100237.3

Ttf1-201, Transcript of Transcription termination factor 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ttf1, Length 4,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Vipas39Q8BGQ1 491 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AsphQ8BSY0 741 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Arhgap24Q8C4V1 747 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lonp1Q8CGK3 949 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Prpf6Q91YR7 941 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Spc24Q9D083 201 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IgtpQ9DCE9 423 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cd2apQ9JLQ0 637 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Peg12Q9WVA7 283 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GakQ99KY4 1305 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zmynd8A2A484 1235 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MybP06876 636 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Zfy1P10925 782 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AgtP11859 477 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyp11b2P15539 500 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 S100bP50114 92 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ephb4P54761 987 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lamc2Q61092 1191 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trpc6Q61143 930 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Daam2Q80U19 1115 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ube3cQ80U95 1083 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gpr139Q80UC8 345 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rint1Q8BZ36 792 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Etnk1Q9D4V0 363 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ppp2r3cQ9JK24 453 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trem1Q9JKE2 230 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Vnn1Q9Z0K8 512 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm45194A0A140LJG2 572 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ap1m1P35585 423 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gjb4Q02738 266 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 MamstrQ0ZCJ7 421 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp13Q5BKP2 858 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NfrkbQ6PIJ4 1296 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Eps8l1Q8R5F8 716 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyp2c70Q91W64 489 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sf3b3Q921M3 1217 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tmed5Q9CXE7 229 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cep72Q9D3R3 646 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Taf7lQ9D3R9 471 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tube1Q9D6T1 475 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Jph1Q9ET80 660 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trip6Q9Z1Y4 480 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa7.37□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm5936A2BG95 728 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Gm5640A3KG49 728 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Ttll3A4Q9E5 927 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Casp14O89094 257 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cdc25aP48964 514 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Stmn2P55821 179 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 SpertQ32MG2 446 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cspg5Q71M36 566 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fam205cQ80YD3 371 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rab15Q8K386 212 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Med10Q9CXU0 135 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Plpp6Q9D4F2 292 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Trp53inp1Q9QXE4 239 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cep85lA0A1W2P884 806 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cfap221A9Q751 836 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyp2d34L7N463 504 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Klc1O88447 541 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CopeO89079 308 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Hsd3b3P26150 373 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Wee1P47810 646 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IvlP48997 467 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Setd4P58467 439 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mcl1P97287 331 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Nudt18Q3U2V3 323 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Smarca1Q6PGB8 1046 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 R3hdm2Q80TM6 1044 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cep104Q80V31 926 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Eif2aQ8BJW6 581 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IrgcQ8C262 412 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Bag2Q91YN9 210 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tom1l1Q923U0 474 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Tex13bQ99MW5 186 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 IdeQ9JHR7 1019 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NktrP30415 1453 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Etnk2A7MCT6 385 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Psmd14O35593 310 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Stk10O55098 966 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Usp4P35123 962 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 NsfP46460 744 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 CebpaP53566 359 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 GmpsQ3THK7 693 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lrig2Q52KR2 1054 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Rgl1Q60695 768 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Fstl1Q62356 306 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Sh3gl1Q62419 368 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Spata24Q6P926 205 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 AdalQ80SY6 360 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Cyp26b1Q811W2 512 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Aldh5a1Q8BWF0 523 aa7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Lsm14bQ8CGC4 385 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
Ttf1-201ENSMUST00000100237 Erich5Q8K0S2 362 aa7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms