Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0S2

Erich5, Glutamate-rich protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich5Q8K0S2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Erich5Q8K0S2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Erich5Q8K0S2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Erich5Q8K0S2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Erich5Q8K0S2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Erich5Q8K0S2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Erich5Q8K0S2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Erich5Q8K0S2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Erich5Q8K0S2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Erich5Q8K0S2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Erich5Q8K0S2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Erich5Q8K0S2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Erich5Q8K0S2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Erich5Q8K0S2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Erich5Q8K0S2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Erich5Q8K0S2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Erich5Q8K0S2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Erich5Q8K0S2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Erich5Q8K0S2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Erich5Q8K0S2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Erich5Q8K0S2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Erich5Q8K0S2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Erich5Q8K0S2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Erich5Q8K0S2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Erich5Q8K0S2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Erich5Q8K0S2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Erich5Q8K0S2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Erich5Q8K0S2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Erich5Q8K0S2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Erich5Q8K0S2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Erich5Q8K0S2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Erich5Q8K0S2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Erich5Q8K0S2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Erich5Q8K0S2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Erich5Q8K0S2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Erich5Q8K0S2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Erich5Q8K0S2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Erich5Q8K0S2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Erich5Q8K0S2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Erich5Q8K0S2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Erich5Q8K0S2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Erich5Q8K0S2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich5Q8K0S2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich5Q8K0S2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich5Q8K0S2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich5Q8K0S2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Erich5Q8K0S2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Erich5Q8K0S2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Erich5Q8K0S2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Erich5Q8K0S2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Erich5Q8K0S2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Erich5Q8K0S2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Erich5Q8K0S2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Erich5Q8K0S2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Erich5Q8K0S2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Erich5Q8K0S2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Erich5Q8K0S2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Erich5Q8K0S2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Erich5Q8K0S2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Erich5Q8K0S2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Erich5Q8K0S2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Erich5Q8K0S2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Erich5Q8K0S2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Erich5Q8K0S2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Erich5Q8K0S2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Erich5Q8K0S2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich5Q8K0S2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Erich5Q8K0S2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Erich5Q8K0S2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Erich5Q8K0S2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Erich5Q8K0S2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Erich5Q8K0S2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erich5Q8K0S2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Erich5Q8K0S2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erich5Q8K0S2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Erich5Q8K0S2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Erich5Q8K0S2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Erich5Q8K0S2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Erich5Q8K0S2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Erich5Q8K0S2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Erich5Q8K0S2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Erich5Q8K0S2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Erich5Q8K0S2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Erich5Q8K0S2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Erich5Q8K0S2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Erich5Q8K0S2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Erich5Q8K0S2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Erich5Q8K0S2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Erich5Q8K0S2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Erich5Q8K0S2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erich5Q8K0S2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Erich5Q8K0S2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Erich5Q8K0S2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Erich5Q8K0S2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Erich5Q8K0S2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms