Protein–RNA interactions for Protein: P55821

Stmn2, Stathmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn2P55821 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
Stmn2P55821 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
Stmn2P55821 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
Stmn2P55821 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Stmn2P55821 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Stmn2P55821 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,5■■■□□ 2,63
Stmn2P55821 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,72■■■□□ 2,51
Stmn2P55821 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Stmn2P55821 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Stmn2P55821 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Stmn2P55821 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Stmn2P55821 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Stmn2P55821 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Stmn2P55821 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Stmn2P55821 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Stmn2P55821 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Stmn2P55821 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stmn2P55821 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Stmn2P55821 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,12■■■□□ 2,25
Stmn2P55821 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Stmn2P55821 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Stmn2P55821 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Stmn2P55821 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Stmn2P55821 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Stmn2P55821 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Stmn2P55821 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Stmn2P55821 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,77■■■□□ 2,2
Stmn2P55821 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
Stmn2P55821 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,76■■■□□ 2,19
Stmn2P55821 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
Stmn2P55821 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Stmn2P55821 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Stmn2P55821 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Stmn2P55821 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Stmn2P55821 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Stmn2P55821 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,33■■■□□ 2,13
Stmn2P55821 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Stmn2P55821 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Stmn2P55821 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Stmn2P55821 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Stmn2P55821 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,21■■■□□ 2,11
Stmn2P55821 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,17■■■□□ 2,1
Stmn2P55821 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Stmn2P55821 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Stmn2P55821 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
Stmn2P55821 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Stmn2P55821 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28,05■■■□□ 2,08
Stmn2P55821 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Stmn2P55821 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Stmn2P55821 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Stmn2P55821 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,76■■■□□ 2,03
Stmn2P55821 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Stmn2P55821 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Stmn2P55821 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Stmn2P55821 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Stmn2P55821 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,69■■■□□ 2,02
Stmn2P55821 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Stmn2P55821 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Stmn2P55821 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Stmn2P55821 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Stmn2P55821 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Stmn2P55821 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Stmn2P55821 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Stmn2P55821 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Stmn2P55821 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Stmn2P55821 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Stmn2P55821 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Stmn2P55821 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,96
Stmn2P55821 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Stmn2P55821 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,23■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Stmn2P55821 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Stmn2P55821 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Stmn2P55821 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Stmn2P55821 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Stmn2P55821 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Stmn2P55821 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Stmn2P55821 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Stmn2P55821 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Stmn2P55821 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Stmn2P55821 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Stmn2P55821 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Stmn2P55821 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Stmn2P55821 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Stmn2P55821 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Stmn2P55821 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Stmn2P55821 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
Stmn2P55821 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Stmn2P55821 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,5 ms