Protein–RNA interactions for Protein: P55821

Stmn2, Stathmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn2P55821 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Stmn2P55821 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Stmn2P55821 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Stmn2P55821 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Stmn2P55821 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Stmn2P55821 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Stmn2P55821 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
Stmn2P55821 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Stmn2P55821 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Stmn2P55821 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Stmn2P55821 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Stmn2P55821 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Stmn2P55821 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Stmn2P55821 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Stmn2P55821 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Stmn2P55821 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Stmn2P55821 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stmn2P55821 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Stmn2P55821 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Stmn2P55821 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Stmn2P55821 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Stmn2P55821 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Stmn2P55821 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stmn2P55821 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Stmn2P55821 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Stmn2P55821 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Stmn2P55821 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Stmn2P55821 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stmn2P55821 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Stmn2P55821 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Stmn2P55821 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stmn2P55821 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Stmn2P55821 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Stmn2P55821 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Stmn2P55821 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Stmn2P55821 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Stmn2P55821 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Stmn2P55821 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Stmn2P55821 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Stmn2P55821 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Stmn2P55821 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Stmn2P55821 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stmn2P55821 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Stmn2P55821 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Stmn2P55821 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Stmn2P55821 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Stmn2P55821 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Stmn2P55821 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Stmn2P55821 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Stmn2P55821 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Stmn2P55821 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Stmn2P55821 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Stmn2P55821 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Stmn2P55821 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stmn2P55821 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Stmn2P55821 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stmn2P55821 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Stmn2P55821 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stmn2P55821 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stmn2P55821 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Stmn2P55821 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Stmn2P55821 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Stmn2P55821 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Stmn2P55821 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Stmn2P55821 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stmn2P55821 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stmn2P55821 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stmn2P55821 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Stmn2P55821 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stmn2P55821 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stmn2P55821 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stmn2P55821 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stmn2P55821 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stmn2P55821 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Stmn2P55821 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Stmn2P55821 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Stmn2P55821 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stmn2P55821 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stmn2P55821 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stmn2P55821 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stmn2P55821 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stmn2P55821 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stmn2P55821 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stmn2P55821 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Stmn2P55821 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Stmn2P55821 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stmn2P55821 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stmn2P55821 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms