Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R9

Taf7l, Transcription initiation factor TFIID subunit 7-like, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf7lQ9D3R9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,62■■■■□ 3,13
Taf7lQ9D3R9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,39■■■■□ 3,1
Taf7lQ9D3R9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Taf7lQ9D3R9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,32■■■□□ 2,92
Taf7lQ9D3R9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,41■■■□□ 2,78
Taf7lQ9D3R9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Taf7lQ9D3R9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Taf7lQ9D3R9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,63■■■□□ 2,65
Taf7lQ9D3R9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Taf7lQ9D3R9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Taf7lQ9D3R9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Taf7lQ9D3R9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Taf7lQ9D3R9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Taf7lQ9D3R9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Taf7lQ9D3R9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Taf7lQ9D3R9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Taf7lQ9D3R9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,75■■■□□ 2,51
Taf7lQ9D3R9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Taf7lQ9D3R9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Taf7lQ9D3R9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Taf7lQ9D3R9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Taf7lQ9D3R9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Taf7lQ9D3R9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Taf7lQ9D3R9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,4
Taf7lQ9D3R9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Taf7lQ9D3R9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Taf7lQ9D3R9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Taf7lQ9D3R9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Taf7lQ9D3R9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Taf7lQ9D3R9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Taf7lQ9D3R9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Taf7lQ9D3R9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Taf7lQ9D3R9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Taf7lQ9D3R9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Taf7lQ9D3R9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Taf7lQ9D3R9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Taf7lQ9D3R9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Taf7lQ9D3R9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Taf7lQ9D3R9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Taf7lQ9D3R9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,23■■■□□ 2,27
Taf7lQ9D3R9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Taf7lQ9D3R9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,2■■■□□ 2,27
Taf7lQ9D3R9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Taf7lQ9D3R9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Taf7lQ9D3R9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Taf7lQ9D3R9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Taf7lQ9D3R9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Taf7lQ9D3R9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,86■■■□□ 2,21
Taf7lQ9D3R9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Taf7lQ9D3R9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Taf7lQ9D3R9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Taf7lQ9D3R9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Taf7lQ9D3R9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,78■■■□□ 2,2
Taf7lQ9D3R9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Taf7lQ9D3R9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Taf7lQ9D3R9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Taf7lQ9D3R9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Taf7lQ9D3R9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Taf7lQ9D3R9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Taf7lQ9D3R9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Taf7lQ9D3R9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Taf7lQ9D3R9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Taf7lQ9D3R9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Taf7lQ9D3R9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Taf7lQ9D3R9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
Taf7lQ9D3R9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,41■■■□□ 2,14
Taf7lQ9D3R9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Taf7lQ9D3R9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Taf7lQ9D3R9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28,3■■■□□ 2,12
Taf7lQ9D3R9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Taf7lQ9D3R9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Taf7lQ9D3R9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Taf7lQ9D3R9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Taf7lQ9D3R9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Taf7lQ9D3R9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Taf7lQ9D3R9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Taf7lQ9D3R9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Taf7lQ9D3R9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Taf7lQ9D3R9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Taf7lQ9D3R9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Taf7lQ9D3R9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Taf7lQ9D3R9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Taf7lQ9D3R9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Taf7lQ9D3R9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Taf7lQ9D3R9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Taf7lQ9D3R9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Taf7lQ9D3R9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Taf7lQ9D3R9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Taf7lQ9D3R9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Taf7lQ9D3R9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Taf7lQ9D3R9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Taf7lQ9D3R9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Taf7lQ9D3R9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,52■■■□□ 2
Taf7lQ9D3R9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Taf7lQ9D3R9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Taf7lQ9D3R9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Taf7lQ9D3R9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Taf7lQ9D3R9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Taf7lQ9D3R9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Taf7lQ9D3R9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms