Protein–RNA interactions for Protein: P35585

Ap1m1, AP-1 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1m1P35585 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Ap1m1P35585 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Ap1m1P35585 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ap1m1P35585 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Ap1m1P35585 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Ap1m1P35585 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ap1m1P35585 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ap1m1P35585 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ap1m1P35585 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ap1m1P35585 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ap1m1P35585 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ap1m1P35585 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ap1m1P35585 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ap1m1P35585 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ap1m1P35585 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ap1m1P35585 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ap1m1P35585 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ap1m1P35585 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Ap1m1P35585 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Ap1m1P35585 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Ap1m1P35585 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Ap1m1P35585 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Ap1m1P35585 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Ap1m1P35585 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Ap1m1P35585 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ap1m1P35585 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap1m1P35585 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ap1m1P35585 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ap1m1P35585 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ap1m1P35585 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Ap1m1P35585 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ap1m1P35585 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ap1m1P35585 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
Ap1m1P35585 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap1m1P35585 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ap1m1P35585 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ap1m1P35585 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Ap1m1P35585 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Ap1m1P35585 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap1m1P35585 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ap1m1P35585 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ap1m1P35585 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ap1m1P35585 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ap1m1P35585 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap1m1P35585 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ap1m1P35585 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ap1m1P35585 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ap1m1P35585 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap1m1P35585 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ap1m1P35585 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ap1m1P35585 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap1m1P35585 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ap1m1P35585 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Ap1m1P35585 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ap1m1P35585 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ap1m1P35585 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Ap1m1P35585 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Ap1m1P35585 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ap1m1P35585 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ap1m1P35585 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap1m1P35585 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ap1m1P35585 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ap1m1P35585 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Ap1m1P35585 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ap1m1P35585 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ap1m1P35585 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ap1m1P35585 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ap1m1P35585 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ap1m1P35585 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ap1m1P35585 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ap1m1P35585 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ap1m1P35585 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap1m1P35585 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap1m1P35585 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ap1m1P35585 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ap1m1P35585 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap1m1P35585 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ap1m1P35585 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ap1m1P35585 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ap1m1P35585 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ap1m1P35585 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ap1m1P35585 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ap1m1P35585 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ap1m1P35585 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap1m1P35585 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ap1m1P35585 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ap1m1P35585 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Ap1m1P35585 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap1m1P35585 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ap1m1P35585 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Ap1m1P35585 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ap1m1P35585 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap1m1P35585 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ap1m1P35585 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ap1m1P35585 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ap1m1P35585 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap1m1P35585 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ap1m1P35585 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ap1m1P35585 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Ap1m1P35585 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms