Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZCJ7

Mamstr, MEF2-activating motif and SAP domain-containing transcriptional regulator, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MamstrQ0ZCJ7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
MamstrQ0ZCJ7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MamstrQ0ZCJ7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
MamstrQ0ZCJ7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
MamstrQ0ZCJ7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
MamstrQ0ZCJ7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
MamstrQ0ZCJ7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MamstrQ0ZCJ7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MamstrQ0ZCJ7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MamstrQ0ZCJ7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MamstrQ0ZCJ7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MamstrQ0ZCJ7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
MamstrQ0ZCJ7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MamstrQ0ZCJ7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MamstrQ0ZCJ7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MamstrQ0ZCJ7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MamstrQ0ZCJ7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MamstrQ0ZCJ7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MamstrQ0ZCJ7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MamstrQ0ZCJ7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MamstrQ0ZCJ7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MamstrQ0ZCJ7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
MamstrQ0ZCJ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MamstrQ0ZCJ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MamstrQ0ZCJ7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MamstrQ0ZCJ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MamstrQ0ZCJ7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MamstrQ0ZCJ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MamstrQ0ZCJ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MamstrQ0ZCJ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MamstrQ0ZCJ7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MamstrQ0ZCJ7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MamstrQ0ZCJ7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MamstrQ0ZCJ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MamstrQ0ZCJ7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MamstrQ0ZCJ7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MamstrQ0ZCJ7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MamstrQ0ZCJ7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MamstrQ0ZCJ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MamstrQ0ZCJ7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
MamstrQ0ZCJ7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MamstrQ0ZCJ7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MamstrQ0ZCJ7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MamstrQ0ZCJ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MamstrQ0ZCJ7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MamstrQ0ZCJ7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MamstrQ0ZCJ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MamstrQ0ZCJ7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MamstrQ0ZCJ7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MamstrQ0ZCJ7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MamstrQ0ZCJ7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MamstrQ0ZCJ7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MamstrQ0ZCJ7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MamstrQ0ZCJ7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
MamstrQ0ZCJ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MamstrQ0ZCJ7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MamstrQ0ZCJ7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MamstrQ0ZCJ7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MamstrQ0ZCJ7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MamstrQ0ZCJ7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MamstrQ0ZCJ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MamstrQ0ZCJ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MamstrQ0ZCJ7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MamstrQ0ZCJ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MamstrQ0ZCJ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MamstrQ0ZCJ7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MamstrQ0ZCJ7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MamstrQ0ZCJ7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MamstrQ0ZCJ7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MamstrQ0ZCJ7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MamstrQ0ZCJ7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MamstrQ0ZCJ7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MamstrQ0ZCJ7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MamstrQ0ZCJ7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MamstrQ0ZCJ7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MamstrQ0ZCJ7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MamstrQ0ZCJ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MamstrQ0ZCJ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MamstrQ0ZCJ7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MamstrQ0ZCJ7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MamstrQ0ZCJ7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MamstrQ0ZCJ7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MamstrQ0ZCJ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MamstrQ0ZCJ7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MamstrQ0ZCJ7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MamstrQ0ZCJ7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MamstrQ0ZCJ7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MamstrQ0ZCJ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MamstrQ0ZCJ7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms