Protein–RNA interactions for Protein: Q8K386

Rab15, Ras-related protein Rab-15, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab15Q8K386 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
Rab15Q8K386 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rab15Q8K386 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Rab15Q8K386 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Rab15Q8K386 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30,7■■■□□ 2,51
Rab15Q8K386 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Rab15Q8K386 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Rab15Q8K386 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Rab15Q8K386 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Rab15Q8K386 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Rab15Q8K386 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,12■■■□□ 2,25
Rab15Q8K386 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Rab15Q8K386 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Rab15Q8K386 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Rab15Q8K386 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Rab15Q8K386 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Rab15Q8K386 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,74■■■□□ 2,19
Rab15Q8K386 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Rab15Q8K386 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Rab15Q8K386 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Rab15Q8K386 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Rab15Q8K386 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Rab15Q8K386 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Rab15Q8K386 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Rab15Q8K386 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Rab15Q8K386 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab15Q8K386 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,75■■■□□ 2,03
Rab15Q8K386 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Rab15Q8K386 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Rab15Q8K386 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Rab15Q8K386 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Rab15Q8K386 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Rab15Q8K386 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Rab15Q8K386 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Rab15Q8K386 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rab15Q8K386 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,37■■□□□ 1,97
Rab15Q8K386 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Rab15Q8K386 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Rab15Q8K386 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rab15Q8K386 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rab15Q8K386 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rab15Q8K386 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Rab15Q8K386 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Rab15Q8K386 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rab15Q8K386 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rab15Q8K386 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rab15Q8K386 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rab15Q8K386 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Rab15Q8K386 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rab15Q8K386 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Rab15Q8K386 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Rab15Q8K386 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,53■■□□□ 1,84
Rab15Q8K386 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Rab15Q8K386 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rab15Q8K386 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rab15Q8K386 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rab15Q8K386 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rab15Q8K386 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rab15Q8K386 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rab15Q8K386 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Rab15Q8K386 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Rab15Q8K386 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rab15Q8K386 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rab15Q8K386 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rab15Q8K386 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rab15Q8K386 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rab15Q8K386 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rab15Q8K386 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rab15Q8K386 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rab15Q8K386 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rab15Q8K386 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rab15Q8K386 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rab15Q8K386 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rab15Q8K386 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Rab15Q8K386 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rab15Q8K386 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rab15Q8K386 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rab15Q8K386 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rab15Q8K386 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rab15Q8K386 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Rab15Q8K386 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
Rab15Q8K386 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rab15Q8K386 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rab15Q8K386 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rab15Q8K386 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rab15Q8K386 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rab15Q8K386 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rab15Q8K386 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rab15Q8K386 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rab15Q8K386 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rab15Q8K386 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rab15Q8K386 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rab15Q8K386 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Rab15Q8K386 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rab15Q8K386 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rab15Q8K386 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Rab15Q8K386 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Rab15Q8K386 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,54■■□□□ 1,68
Rab15Q8K386 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Rab15Q8K386 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,5 ms