Protein–RNA interactions for Protein: Q61092

Lamc2, Laminin subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc2Q61092 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46,03■■■■■ 4,96
Lamc2Q61092 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,58■■■■■ 4,41
Lamc2Q61092 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,05■■■■■ 4,32
Lamc2Q61092 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40,18■■■■■ 4,02
Lamc2Q61092 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,9■■■■□ 3,98
Lamc2Q61092 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Lamc2Q61092 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Lamc2Q61092 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Lamc2Q61092 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Lamc2Q61092 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Lamc2Q61092 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,48■■■■□ 3,75
Lamc2Q61092 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,43■■■■□ 3,74
Lamc2Q61092 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,72
Lamc2Q61092 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,8■■■■□ 3,64
Lamc2Q61092 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Lamc2Q61092 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,23■■■■□ 3,55
Lamc2Q61092 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37,18■■■■□ 3,54
Lamc2Q61092 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Lamc2Q61092 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Lamc2Q61092 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,96■■■■□ 3,51
Lamc2Q61092 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,94■■■■□ 3,5
Lamc2Q61092 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Lamc2Q61092 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Lamc2Q61092 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,69■■■■□ 3,46
Lamc2Q61092 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,44
Lamc2Q61092 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Lamc2Q61092 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Lamc2Q61092 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Lamc2Q61092 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,4■■■■□ 3,42
Lamc2Q61092 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Lamc2Q61092 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
Lamc2Q61092 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
Lamc2Q61092 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,31■■■■□ 3,4
Lamc2Q61092 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36,26■■■■□ 3,39
Lamc2Q61092 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Lamc2Q61092 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Lamc2Q61092 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35,76■■■■□ 3,32
Lamc2Q61092 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,71■■■■□ 3,31
Lamc2Q61092 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35,55■■■■□ 3,28
Lamc2Q61092 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,52■■■■□ 3,28
Lamc2Q61092 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,46■■■■□ 3,27
Lamc2Q61092 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Lamc2Q61092 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Lamc2Q61092 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,31■■■■□ 3,24
Lamc2Q61092 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35,23■■■■□ 3,23
Lamc2Q61092 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,12■■■■□ 3,21
Lamc2Q61092 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Lamc2Q61092 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Lamc2Q61092 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Lamc2Q61092 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,93■■■■□ 3,18
Lamc2Q61092 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,89■■■■□ 3,18
Lamc2Q61092 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Lamc2Q61092 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,72■■■■□ 3,15
Lamc2Q61092 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,66■■■■□ 3,14
Lamc2Q61092 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,64■■■■□ 3,14
Lamc2Q61092 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,63■■■■□ 3,13
Lamc2Q61092 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,56■■■■□ 3,12
Lamc2Q61092 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,53■■■■□ 3,12
Lamc2Q61092 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,52■■■■□ 3,12
Lamc2Q61092 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,45■■■■□ 3,1
Lamc2Q61092 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,4■■■■□ 3,1
Lamc2Q61092 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,36■■■■□ 3,09
Lamc2Q61092 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Lamc2Q61092 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Lamc2Q61092 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34,3■■■■□ 3,08
Lamc2Q61092 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,23■■■■□ 3,07
Lamc2Q61092 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Lamc2Q61092 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
Lamc2Q61092 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
Lamc2Q61092 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,14■■■■□ 3,06
Lamc2Q61092 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
Lamc2Q61092 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34,08■■■■□ 3,05
Lamc2Q61092 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,06■■■■□ 3,04
Lamc2Q61092 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34,05■■■■□ 3,04
Lamc2Q61092 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Lamc2Q61092 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Lamc2Q61092 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,02■■■■□ 3,04
Lamc2Q61092 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Lamc2Q61092 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Lamc2Q61092 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Lamc2Q61092 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,89■■■■□ 3,02
Lamc2Q61092 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc2Q61092 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Lamc2Q61092 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,87■■■■□ 3,01
Lamc2Q61092 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,8■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,78■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,77■■■■□ 3
Lamc2Q61092 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Lamc2Q61092 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Lamc2Q61092 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Lamc2Q61092 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Lamc2Q61092 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,62■■■□□ 2,97
Lamc2Q61092 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,61■■■□□ 2,97
Lamc2Q61092 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
Lamc2Q61092 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,56■■■□□ 2,96
Lamc2Q61092 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33,51■■■□□ 2,96
Lamc2Q61092 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Lamc2Q61092 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
Lamc2Q61092 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,47■■■□□ 2,95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms