Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
Gjb4Q02738 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Gjb4Q02738 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Gjb4Q02738 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Gjb4Q02738 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Gjb4Q02738 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Gjb4Q02738 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Gjb4Q02738 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Gjb4Q02738 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Gjb4Q02738 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Gjb4Q02738 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Gjb4Q02738 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Gjb4Q02738 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Gjb4Q02738 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Gjb4Q02738 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Gjb4Q02738 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Gjb4Q02738 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Gjb4Q02738 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Gjb4Q02738 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Gjb4Q02738 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Gjb4Q02738 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Gjb4Q02738 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Gjb4Q02738 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Gjb4Q02738 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Gjb4Q02738 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Gjb4Q02738 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Gjb4Q02738 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Gjb4Q02738 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Gjb4Q02738 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Gjb4Q02738 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Gjb4Q02738 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Gjb4Q02738 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Gjb4Q02738 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Gjb4Q02738 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.09
Gjb4Q02738 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Gjb4Q02738 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Gjb4Q02738 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Gjb4Q02738 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gjb4Q02738 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gjb4Q02738 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gjb4Q02738 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gjb4Q02738 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gjb4Q02738 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Gjb4Q02738 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Gjb4Q02738 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Gjb4Q02738 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Gjb4Q02738 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gjb4Q02738 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Gjb4Q02738 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Gjb4Q02738 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Gjb4Q02738 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Gjb4Q02738 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Gjb4Q02738 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
Gjb4Q02738 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Gjb4Q02738 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Gjb4Q02738 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Gjb4Q02738 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Gjb4Q02738 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Gjb4Q02738 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Gjb4Q02738 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gjb4Q02738 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Gjb4Q02738 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gjb4Q02738 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gjb4Q02738 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Gjb4Q02738 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Gjb4Q02738 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gjb4Q02738 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Gjb4Q02738 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Gjb4Q02738 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Gjb4Q02738 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Gjb4Q02738 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gjb4Q02738 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Gjb4Q02738 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gjb4Q02738 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gjb4Q02738 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Gjb4Q02738 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gjb4Q02738 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Gjb4Q02738 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gjb4Q02738 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gjb4Q02738 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Gjb4Q02738 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Gjb4Q02738 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gjb4Q02738 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gjb4Q02738 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Gjb4Q02738 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Gjb4Q02738 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gjb4Q02738 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Gjb4Q02738 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Gjb4Q02738 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Gjb4Q02738 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gjb4Q02738 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
Gjb4Q02738 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gjb4Q02738 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gjb4Q02738 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Gjb4Q02738 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gjb4Q02738 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gjb4Q02738 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gjb4Q02738 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Gjb4Q02738 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gjb4Q02738 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms