RNA–Protein interactions for RNA: YMR065W

KAR5, Transcript of Protein required for nuclear membrane fusion during karyogamy, yeast

Gene KAR5, Length 1,515 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KAR5	YMR065W	YCH1	P42937	148 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	APJ1	P53940	528 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	DDC1	Q08949	612 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	IRC20	Q06554	1556 aa		3.26	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	UIP5	P36137	443 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	PEX32	P38292	413 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	MMS21	P38632	267 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	DNF1	P32660	1571 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TAF2	P23255	1407 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	MET5	P47169	1442 aa		3.25	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	CAJ1	P39101	391 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	NRM1	P53718	249 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	HCH1	P53834	153 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	API2	Q04413	109 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	MMT2	Q08970	484 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TAF10	Q12030	206 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	RPN6	Q12377	434 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	CCH1	P50077	2039 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	LTE1	P07866	1435 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	SIN3	P22579	1536 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	DCC1	P25559	380 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	FMT1	P32785	401 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	EFM1	P38732	585 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YFR018C	P43599	363 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	NAS6	P50086	228 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YGR016W	P53209	190 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	SED5	Q01590	340 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	SCS7	Q03529	384 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	SPO24	Q3E752	67 aa		3.24	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	OPI1	P21957	404 aa		3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	FHL1	P39521	936 aa		3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	HIT1	P46973	164 aa		3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	YOL029C	Q08187	201 aa		3.23	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TY1B-BR	Q12193	1756 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TAE1	P38340	232 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	NAS2	P40555	220 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	MRX8	Q05473	314 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	APC2	Q12440	853 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	AUS1	Q08409	1394 aa		3.22	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	RKR1	Q04781	1562 aa		3.21	□□□□□ -1.89
KAR5	YMR065W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-C	P25384	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TIP20	P33891	701 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	PGC1	Q08959	321 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	YDR262W	Q12331	272 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	ESP1	Q03018	1630 aa		3.21	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	CTA1	P15202	515 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	RBK1	P25332	333 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	ITR2	P30606	609 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TAF6	P53040	516 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	BUR2	Q05949	395 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	MHP1	P43638	1398 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	RPO31	P04051	1460 aa		3.2	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	UFD4	P33202	1483 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	VPS63	O13549	108 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	HST4	P53688	370 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	FAR10	Q06001	478 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	FAB1	P34756	2278 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	FLO11	P08640	1367 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	CKA2	P19454	339 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	MEI5	P32489	222 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	YIR035C	P40579	254 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	UFE1	P41834	346 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	PRM7	Q12459	698 aa		3.19	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	CHD1	P32657	1468 aa		3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	ACB1	P31787	87 aa		3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	FRT2	P39734	528 aa		3.18	□□□□□ -1.9
KAR5	YMR065W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9

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