RNA–Protein interactions for RNA: YLR318W

EST2, Transcript of Reverse transcriptase subunit of the telomerase holoenzyme, yeast

Gene EST2, Length 2,655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST2	YLR318W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PTP1	P25044	335 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	DCC1	P25559	380 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	NAM9	P27929	486 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	KAR9	P32526	644 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YEF1	P32622	495 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PDR3	P33200	976 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CSE1	P33307	960 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TIR2	P33890	251 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SUR2	P38992	349 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CSM2	P40465	213 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YNL320W	P42840	284 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	IRC7	P43623	340 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RTT101	P47050	842 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YJR012C	P47087	207 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	IBA57	P47158	497 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	MRM2	P53123	320 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	POP6	P53218	158 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YNR048W	P53740	393 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	DIA1	P54005	336 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	MRS2	Q01926	470 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	NUP116	Q02630	1113 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	FAR8	Q05040	523 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ARR2	Q06597	130 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YDL144C	Q07589	356 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YAP7	Q08182	245 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ALE1	Q08548	619 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	GRE1	Q08969	168 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YLR112W	Q12130	139 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YLR108C	Q12259	485 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ARP6	Q12509	438 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		1.24	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ATP6	P00854	259 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CAP2	P13517	287 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ERD1	P16151	362 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SLY1	P22213	666 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TOA2	P32774	122 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	MRPL6	P32904	214 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ECM15	P35195	104 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	THI80	P35202	319 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CHK1	P38147	527 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ECM8	P38246	354 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YHR035W	P38769	630 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	VPS52	P39904	641 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SIM1	P40472	476 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YFL040W	P43562	540 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SFH5	P47008	294 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SWC4	P53201	476 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RRN9	P53437	365 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	KIN4	Q01919	800 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RTT103	Q05543	409 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	THI7	Q05998	598 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	NDE2	Q07500	545 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PLB3	Q08108	686 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YPL199C	Q08954	240 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RPN13	O13563	156 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.23	□□□□□ -2.21	not detected
EST2	YLR318W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	HEM15	P16622	393 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	POF1	P25576	258 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	COQ3	P27680	312 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	PEX3	P28795	441 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CTS1	P29029	562 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	GPX2	P38143	162 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CUE1	P38428	203 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SRP14	P38985	146 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	RTS2	P40962	232 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YCH1	P42937	148 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	YGR067C	P53243	804 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ATP23	P53722	227 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	MTQ1	P53944	314 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ASI3	P53983	676 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	ODC1	Q03028	310 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	SNX41	Q04053	625 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	VBA1	Q04301	562 aa		1.23	□□□□□ -2.21
EST2	YLR318W	CDC123	Q05791	360 aa		1.23	□□□□□ -2.21

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