RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	PAC11	P40960	533 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	IRC6	P43615	237 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	HIT1	P46973	164 aa		-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	-0.02	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	CDC7	P06243	507 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	CKA1	P15790	372 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YSC83	P32792	385 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YHR045W	P38775	560 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DSE1	P40077	573 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	LCB2	P40970	561 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RTT102	P53330	157 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	NUP49	Q02199	472 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	ROY1	Q04847	553 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	TAF10	Q12030	206 aa		-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	-0.03	□□□□□ -2.41
EST1	YLR233C	YOL162W	P0CF19	215 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ATG15	P25641	520 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	-0.04	□□□□□ -2.42	not detected
EST1	YLR233C	SLM4	P38247	162 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YHL044W	P38727	235 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MNL1	P38888	796 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SER3	P40054	469 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	EPL1	P43572	832 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MND1	P53102	219 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SLM2	P53955	656 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SPO77	Q06134	477 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SHS1	Q07657	551 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	AAD15	Q08361	143 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PRR2	Q12310	699 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YPL247C	Q12523	523 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	UBA3	Q99344	299 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YCR102C	P25608	368 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YCR051W	P25631	222 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PHO91	P27514	894 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	VPH2	P32341	215 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	VAM7	P32912	316 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	KDX1	P36005	433 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YOR062C	P36025	268 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PCH2	P38126	564 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PMT4	P46971	762 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	BIO4	P53630	237 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CIK1	Q01649	594 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	NDL1	Q06568	189 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	AGC1	Q12482	902 aa		-0.04	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SGA1	P08019	549 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	REC107	P21651	314 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YHR182W	P38870	785 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	GLE2	P40066	365 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	COG3	P40094	801 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YNL320W	P42840	284 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MPS2	P53159	387 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TPC1	P53257	314 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	OSH6	Q02201	448 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	VPS72	Q03388	795 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TAF11	Q04226	346 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SPH1	Q06160	661 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YLR456W	Q06199	204 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CTS2	Q06350	511 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MIM1	Q08176	113 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RRI2	Q12348	645 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPN6	Q12377	434 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	AFI1	Q99222	893 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MRP7	P12687	371 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	-0.05	□□□□□ -2.42	not detected
EST1	YLR233C	CPR2	P23285	205 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	COY1	P34237	679 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	-0.05	□□□□□ -2.42	not detected
EST1	YLR233C	YKR045C	P36138	183 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	HUA1	P40325	198 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PEP8	P40335	379 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	LST7	P53237	242 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RSM27	P53305	110 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YGR266W	P53326	701 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CAB4	P53332	305 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	BUR2	Q05949	395 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YOL019W	Q08157	551 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ISA2	Q12425	185 aa		-0.05	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		-0.05	□□□□□ -2.42

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