RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	ALE1	Q08548	619 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	2.92	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	MSB2	P32334	1306 aa		2.92	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	LDS1	P31379	325 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	SPL2	P38839	148 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	YHR177W	P38867	453 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	YLR177W	Q06251	628 aa		2.91	□□□□□ -1.94
YKR070W	YKR070W	HEM4	P06174	275 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	COS9	P36034	407 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YBR241C	P38142	488 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	CIN2	P46670	268 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	VEL1	P53058	206 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MLC1	P53141	149 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	VHT1	P53241	593 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SHS1	Q07657	551 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	IES4	Q08561	116 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YDL109C	Q12103	647 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	LDB17	Q12342	491 aa		2.9	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	ECT1	P33412	323 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MOB1	P40484	314 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SNL1	P40548	159 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	GAS2	Q06135	555 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	GAT3	Q07928	141 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	PEX27	Q08580	376 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SRO7	Q12038	1033 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SFM1	Q12314	213 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YOR338W	Q99326	363 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SWI1	P09547	1314 aa		2.89	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MEC1	P38111	2368 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MAS2	P11914	482 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	JEM1	P40358	645 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	VAC7	P53950	1165 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MCT1	Q12283	360 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	TRA1	P38811	3744 aa		2.88	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	PUT4	P15380	627 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	PDC2	P32896	925 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YHR182W	P38870	785 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	HEM14	P40012	539 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	KEG1	P43614	200 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RNH201	P53942	307 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	IRC4	Q03036	179 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YLH47	Q06493	454 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YFH1	Q07540	174 aa		2.87	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPS19A	P07280	144 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPS19B	P07281	144 aa	Predicted RBP	2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	POX1	P13711	748 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SNA3	P14359	133 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MSK1	P32048	576 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	ANP1	P32629	500 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.86	□□□□□ -1.95	not detected
YKR070W	YKR070W	ECM34	P38728	170 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YJR030C	P47101	745 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	ATP16	Q12165	160 aa		2.86	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	UNG1	P12887	359 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	EPT1	P22140	391 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	TOA1	P32773	286 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	ATP22	P50273	684 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	BIO3	P50277	480 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	MPS2	P53159	387 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	SLT2	Q00772	484 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YOL075C	Q08234	1294 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	HIF1	Q12373	385 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RAX2	Q12465	1220 aa		2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	2.85	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	PSO2	P30620	661 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	YKR015C	P36111	568 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	CHL4	P38907	458 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	STB1	P42845	420 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	GLE1	Q12315	538 aa		2.84	□□□□□ -1.95
YKR070W	YKR070W	RPL43A	P0CX25	92 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	RPL43B	P0CX26	92 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	AIM23	P47015	356 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	CDH1	P53197	566 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	RET3	P53600	189 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	MRX11	Q03079	207 aa		2.83	□□□□□ -1.96
YKR070W	YKR070W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.3 ms