RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	MDV1	P47025	714 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	STB4	P50104	949 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PHO23	P50947	330 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ARO80	Q04052	950 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YPL199C	Q08954	240 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	FRE7	Q12333	620 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SWM1	Q12379	170 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SNF8	Q12483	233 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	FSH3	Q99369	266 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PET20	Q99373	253 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPB8	P20436	146 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CKI1	P20485	582 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ACH1	P32316	526 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TAF14	P35189	244 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SEN34	P39707	275 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YKE4	P40544	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	IRC7	P43623	340 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YJR154W	P47181	346 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SBH2	P52871	88 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PKP2	P53170	491 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ZRG17	P53735	605 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MTQ1	P53944	314 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YML122C	Q03207	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	EMP46	Q12396	444 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.05	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	COX3	P00420	269 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	AAC1	P04710	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPO26	P20435	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	OAR1	P35731	278 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ECM8	P38246	354 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SHG1	P38337	142 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	UBA4	P38820	440 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	IKI1	P38874	309 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	VRG4	P40107	337 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	COA1	P40452	197 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	BAP3	P41815	604 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	UFE1	P41834	346 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SNG1	P46950	547 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YJR030C	P47101	745 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SSN8	P47821	323 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GTF1	P53260	183 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YNL140C	P53910	189 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TIM8	P57744	87 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NDE2	Q07500	545 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TEN1	Q07921	160 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ACF2	Q12168	779 aa		4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SIR3	P06701	978 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	COR1	P07256	457 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CBS2	P14905	389 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NUP2	P32499	720 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PEX2	P32800	271 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YET1	P35723	206 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	HES1	P35843	434 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MCH2	P36032	473 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GMH1	P36125	273 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	DER1	P38307	211 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YHR177W	P38867	453 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CYC2	P38909	366 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MBB1	P39534	108 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ECM10	P39987	644 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	POP1	P41812	875 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PHO86	P46956	311 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YJR056C	P47115	236 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CCC1	P47818	322 aa		4.03	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MSY1	P48527	492 aa		4.03	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.5 ms