RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C YNL320WP42840 284 aa1.35□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C YCH1P42937 148 aa1.35□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data1.35□□□□□ -2.19not detected
YKL063CYKL063C DSE1P40077 573 aa1.34□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C CSM3Q04659 317 aa1.34□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C CDD1Q06549 142 aa1.34□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP1.34□□□□□ -2.19
YKL063CYKL063C CDC42P19073 191 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C ARO4P32449 370 aaKnown RBP1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C PCH2P38126 564 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C IST2P38250 946 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C EFM1P38732 585 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C EPL1P43572 832 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C ECO1P43605 281 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C YGL118CP53132 145 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C MIM1Q08176 113 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C SRN2Q99176 213 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C MHP1P43638 1398 aa1.33□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C CTA1P15202 515 aa1.32□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C CKI1P20485 582 aa1.32□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C INO2P26798 304 aa1.32□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C ATG12P38316 186 aa1.32□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C CIK1Q01649 594 aa1.32□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C SPS100P13130 326 aa1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C UTR1P21373 530 aa1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C EFB1P32471 206 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C VMA8P32610 256 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C MRPS5P33759 307 aa1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C YGP1P38616 354 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data1.31□□□□□ -2.2 RIP-Chip
YKL063CYKL063C YFR045WP43617 309 aa1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C HSH155P49955 971 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C NAT4Q04751 285 aa1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C SGT2Q12118 346 aaKnown RBP1.31□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C MNE1P24720 663 aa1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C PEX5P35056 612 aa1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C PCL7P40186 285 aa1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C YIL054WP40524 105 aa1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C YDR114CQ04597 100 aa1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C RPN8Q08723 338 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C RAD1P06777 1100 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C SAG1P20840 650 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C GRR1P24814 1151 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C MXR2P25566 168 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C IML3P38265 245 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C YJL055WP47044 245 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C RRB1Q04225 511 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C FEX1Q08913 375 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C FEX2Q08991 375 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C IES3Q12345 250 aa1.29□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C SLM1P40485 686 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C CSI1Q04368 295 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C APC5Q08683 685 aa1.28□□□□□ -2.2
YKL063CYKL063C DAP2P18962 818 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C ITR2P30606 609 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PMT4P46971 762 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C ACT1P60010 375 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C TFC7Q12415 435 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MRX4Q12467 430 aa1.27□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C ARF2P19146 181 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PRE7P23724 241 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PXA2P34230 853 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MED8P38304 223 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C SMF2P38778 549 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C ASP1P38986 381 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MIC19P43594 170 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C NBP1P52919 319 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C SDS23P53172 527 aa1.26□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MDL1P33310 695 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MLC1P53141 149 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YNL040WP53960 456 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C GLE1Q12315 538 aa1.25□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YBL028CP38202 106 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PET8P38921 284 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MNN5P46982 586 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C SPH1Q06160 661 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YFH1Q07540 174 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C SFG1Q12507 346 aa1.24□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C REP1P03871 373 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C RSA4P25382 515 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YKL187CP34231 750 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YSW1P38280 609 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PIR5P46999 287 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YHC3P47040 408 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YML6P51998 286 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MPS2P53159 387 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C SSU72P53538 206 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C YNR068CP53754 272 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C PEX30Q06169 523 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C TRM10Q12400 293 aa1.23□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C MAS1P10507 462 aa1.22□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C KTI12P34253 313 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YKL063CYKL063C CBP2P03874 630 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
YKL063CYKL063C FAA1P30624 700 aaKnown RBP1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms