RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MED8	P38304	223 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MIC19	P43594	170 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ECO1	P43605	281 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YGL118C	P53132	145 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LST7	P53237	242 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YNL095C	P53932	642 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RMT2	Q03305	412 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	AIM33	Q04516	312 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	IES3	Q12345	250 aa		0.43	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	DAP2	P18962	818 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YKL071W	P36086	256 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YHR182W	P38870	785 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	EFM4	P40516	257 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	PMT4	P46971	762 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	PIR5	P46999	287 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CSM3	Q04659	317 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	PEX30	Q06169	523 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MRX4	Q12467	430 aa		0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CKI1	P20485	582 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	UTR1	P21373	530 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	MSK1	P32048	576 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YEL043W	P32618	956 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FCY21	P40039	528 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SLM1	P40485	686 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	DAN1	P47178	298 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SRB7	P47822	140 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SDS23	P53172	527 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	CSI1	Q04368	295 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YDR114C	Q04597	100 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SPH1	Q06160	661 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	VPS68	Q12016	184 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	YOR012W	Q12351	137 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	ISA2	Q12425	185 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	FSH3	Q99369	266 aa		0.41	□□□□□ -2.34
BLI1	YKL061W	RAD1	P06777	1100 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	GRR1	P24814	1151 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PSO2	P30620	661 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MRPS5	P33759	307 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YKL187C	P34231	750 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PCH2	P38126	564 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YIL054W	P40524	105 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	HIT1	P46973	164 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YJR146W	P47174	117 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	UFD1	P53044	361 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SMP3	Q04174	516 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	GYL1	Q04322	720 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	TRM10	Q12400	293 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	TFC7	Q12415	435 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MHP1	P43638	1398 aa		0.4	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SPS100	P13130	326 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MXR2	P25566	168 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CLB6	P32943	380 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PEX5	P35056	612 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	NRG2	P38082	220 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SMF2	P38778	549 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CTM1	P38818	585 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PET8	P38921	284 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YNL320W	P42840	284 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.39	□□□□□ -2.35	not detected
BLI1	YKL061W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	NAT4	Q04751	285 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	DCR2	Q05924	578 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PEX27	Q08580	376 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	ERP3	Q12403	225 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SRN2	Q99176	213 aa		0.39	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	REP1	P03871	373 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	HIS3	P06633	220 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	IML3	P38265	245 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MMS21	P38632	267 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	POP2	P39008	433 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SNL1	P40548	159 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	OSH6	Q02201	448 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	TIM22	Q12328	207 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SFG1	Q12507	346 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.38	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YOL163W	P0CF20	169 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YAK1	P14680	807 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PHO80	P20052	293 aa		0.37	□□□□□ -2.35

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