RNA–Protein interactions for RNA: YJL192C

SOP4, Transcript of ER-membrane protein, yeastyeast

Gene SOP4, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOP4YJL192C YMR010WQ03687 405 aa3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C APC5Q08683 685 aa3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C FRE7Q12333 620 aa3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C DCN1Q12395 269 aa3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YDL199CQ12407 687 aa3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C EFG1Q3E705 233 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ARG81P05085 880 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C CHS1P08004 1131 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PUT1P09368 476 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C KAR1P11927 433 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SNF6P18888 332 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RPS1BP23248 255 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PPH22P23595 377 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C CDC50P25656 391 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C IDH1P28834 360 aaKnown RBP RIP-Chip data3.56□□□□□ -1.84not detected
SOP4YJL192C ERG9P29704 444 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C VMA5P31412 392 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ACB1P31787 87 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RNP1P32385 249 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C HXT4P32467 576 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C KRE6P32486 720 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ECM25P32525 599 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MTC7P32633 139 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C VPS17P32913 551 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MIA40P36046 403 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YKL162CP36052 402 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C TVP38P36164 337 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YBR063CP38083 404 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C LAG1P38703 411 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MDM31P38880 579 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PRM9P39551 298 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ATM1P40416 690 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ATG18P43601 500 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C GTO1P48239 356 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C COS10P52924 374 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C DOC1P53068 250 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ERV14P53173 138 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SHY1P53266 389 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RRN9P53437 365 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C OCA2P53949 197 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MSS11Q03825 758 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YPD1Q07688 167 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C BRX1Q08235 291 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YDR056CQ12025 205 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ZPS1Q12512 249 aa3.56□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ATP4P05626 244 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RPL7AP05737 244 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C UNG1P12887 359 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C AAC3P18238 307 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PRE7P23724 241 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MNE1P24720 663 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C HOM6P31116 359 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C OAC1P32332 324 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SDH3P33421 198 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MSN2P33748 704 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C WBP1P33767 430 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YPT52P36018 234 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MCR1P36060 302 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YBL028CP38202 106 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C NPR2P39923 615 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C AFG3P39925 761 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YEL025CP39991 1188 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PGD1P40356 397 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C POG1P40473 351 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C PKP1P40530 394 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MNT3P40549 630 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C BNA6P43619 295 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MRX5P47007 382 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YDL183CP48569 320 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RPS12P48589 143 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C COS12P53053 380 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ROG1P53118 685 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C JAC1P53193 184 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SWC4P53201 476 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YGR127WP53275 312 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C GOR1P53839 350 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YNL034WP53963 612 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YNL018CP53976 612 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C EGD1Q02642 157 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ARL3Q02804 198 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C CAC2Q04199 468 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YMR087WQ04299 284 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C HLR1Q04429 423 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C AIM32Q04689 311 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C CRF1Q04930 467 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C DCR2Q05924 578 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YPR127WQ06494 345 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C MHR1Q06630 226 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C SDO1Q07953 250 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C ZEO1Q08245 113 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C BSC1Q12140 328 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C RPL7BQ12213 244 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C UBX3Q12229 455 aa3.55□□□□□ -1.84
SOP4YJL192C YLR126CQ12288 251 aa3.55□□□□□ -1.84
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