RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524035.5

MEG3-222, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 2

Gene MEG3, Length 2,853 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-222	ENST00000524035	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ATP8B1	O43520	1251 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	LRRN2	O75325	713 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	KCNA2	P16389	499 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PRKCI	P41743	596 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	OAZ1	P54368	228 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PPP2R5A	Q15172	486 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GPC2	Q8N158	579 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	LCT	P09848	1927 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC169	A6NNP5	214 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF862	O60290	1169 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ACAD9	Q9H845	621 aa		18.68	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	EVI5	O60447	810 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ERLIN1	O75477	346 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PRLR	P16471	622 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GTF2B	Q00403	316 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MS4A14	Q96JA4	679 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	EMSY	Q7Z589	1322 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035		F8VZ95	297 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	KRT13	P13646	458 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	STAT1	P42224	750 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ALCAM	Q13740	583 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	TREML2	Q5T2D2	321 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GPR88	Q9GZN0	384 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		18.67	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SOX5	P35711	763 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	NCKAP1L	P55160	1127 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PPP3CA	Q08209	521 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	FSTL1	Q12841	308 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PTPRO	Q16827	1216 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	WDR93	Q6P2C0	686 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	BSND	Q8WZ55	320 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CEP170P1	Q96L14	293 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	STK33	Q9BYT3	514 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	L1RE1	Q9UN81	338 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ARID2	Q68CP9	1835 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	FER	P16591	822 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	GCLM	P48507	274 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	VAMP7	P51809	220 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	VGLL4	Q14135	290 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC181	Q5TID7	509 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		18.66	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	LMNB1	P20700	586 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	NPTX2	P47972	431 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MAP2K7	O14733	419 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ATP2A1	O14983	1001 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CNTN2	Q02246	1040 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	MYBPC2	Q14324	1141 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	LMO3	Q8TAP4	145 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	TMCO5B	A8MYB1	307 aa		18.64	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	18.64	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	STBD1	O95210	358 aa		18.64	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	ADRB2	P07550	413 aa		18.64	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SP2	Q02086	613 aa		18.64	■□□□□ 0.58
MEG3-222	ENST00000524035	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.58

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms