RNA–Protein interactions for RNA: YNL067W

RPL9B, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L9B, yeast

Gene RPL9B, Length 576 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL9B	YNL067W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RPL9B	YNL067W	YIR007W	P40566	764 aa		5.09	□□□□□ -1.59
RPL9B	YNL067W	NUP85	P46673	744 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	VAC17	P25591	423 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	ACO2	P39533	789 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	YGR035C	P53222	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	ARG82	P07250	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	LSC2	P53312	427 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	TY1A-BL	Q12266	440 aa		5.05	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	AAD14	P42884	376 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	HPF1	Q05164	967 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	TRK2	P28584	889 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	YBL086C	P38177	466 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	TCB1	Q12466	1186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
RPL9B	YNL067W	UBP2	Q01476	1272 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	RSC30	P38781	883 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	CSN12	P47130	423 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	YJR098C	P47139	656 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	DFG5	Q05031	458 aa		5	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	MKS1	P34072	584 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	FIG4	P42837	879 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	LEU3	P08638	886 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	RTT106	P40161	455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	ROG3	P43602	733 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	MTC5	Q03897	1148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	RAD59	Q12223	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RPL9B	YNL067W	AIM7	Q12156	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	TEC1	P18412	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	OSH7	P38755	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	BDS1	Q08347	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	KIN1	P13185	1064 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPL9B	YNL067W	FBP26	P32604	452 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	MDJ1	P35191	511 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	CCP1	P00431	361 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	ATG20	Q07528	640 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	YPR084W	Q06821	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	GUT2	P32191	649 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	ISF1	P32488	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	ICP55	P40051	511 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	DPH6	Q12429	685 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	STE6	P12866	1290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	NSG2	P53898	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	ISU1	Q03020	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	THI72	Q08579	599 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPL9B	YNL067W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	LYS5	P50113	272 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	CUZ1	P53899	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	EMP47	P43555	445 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	CEM1	P39525	442 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	JJJ3	P47138	172 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	FRA1	Q07825	749 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPL9B	YNL067W	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	WTM2	Q12206	467 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	PHM7	Q12252	991 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	AI1	P03875	834 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	DAL1	P32375	460 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	UTR2	P32623	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	YBL036C	P38197	257 aa		4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	VTC4	P47075	721 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	MCM16	Q12262	181 aa		4.75	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	TFB3	Q03290	321 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	TBS1	P38114	1094 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	SSN3	P39073	555 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	UBP15	P50101	1230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	HPC2	Q01448	625 aa		4.73	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	DIT1	P21623	536 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	PKC1	P24583	1151 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
RPL9B	YNL067W	SOH1	P38633	127 aa		4.71	□□□□□ -1.66
RPL9B	YNL067W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
RPL9B	YNL067W	SLA1	P32790	1244 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL9B	YNL067W	CSE4	P36012	229 aa		4.7	□□□□□ -1.66
RPL9B	YNL067W	BRL1	P38770	471 aa		4.7	□□□□□ -1.66

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.6 ms