RNA–Protein interactions for RNA: YNL057W

YNL057W, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL057W, Length 333 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL057W	YNL057W	SPE2	P21182	396 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	MTR4	P47047	1073 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	PEX21	P50091	288 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	BUG1	Q12191	341 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YNL057W	YNL057W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	HPC2	Q01448	625 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	CTT1	P06115	562 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	TOS1	P38288	455 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	6.2	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	MEC3	Q02574	474 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	PUS5	Q06244	254 aa		6.2	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	RCR1	P38212	213 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	KIN4	Q01919	800 aa		6.18	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	CWH41	P53008	833 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	ATG13	Q06628	738 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	MHP1	P43638	1398 aa		6.17	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	DPS1	P04802	557 aa	Known RBP	6.16	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	UTP22	P53254	1237 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	RAD4	P14736	754 aa		6.15	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	YKL222C	P35995	705 aa		6.15	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	GAS4	Q08271	471 aa		6.15	□□□□□ -1.42
YNL057W	YNL057W	RIM15	P43565	1770 aa		6.15	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	RRT14	P40470	206 aa		6.14	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	SIR4	P11978	1358 aa		6.14	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	ERT1	P38140	529 aa		6.13	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	SLI15	P38283	698 aa		6.12	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	TOP1	P04786	769 aa		6.11	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	6.11	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	MST1	P07236	462 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	RSM7	P47150	247 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	FPK1	P53739	893 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	CTI6	Q08923	506 aa		6.1	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	YML133C	Q03099	1374 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	YLL067C	Q07888	1374 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	YLL066C	Q99208	1374 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	BBC1	P47068	1157 aa		6.09	□□□□□ -1.43
YNL057W	YNL057W	TOM1	Q03280	3268 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	YOR238W	Q08634	303 aa		6.08	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	YLR278C	Q05854	1341 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	NYV1	Q12255	253 aa		6.07	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	AI2	P03876	854 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	RTF1	P53064	558 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	YBP2	P53169	641 aa		6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	TUM1	Q08686	304 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.05	□□□□□ -1.44	not detected
YNL057W	YNL057W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		6.05	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	SDH2	P21801	266 aa		6.04	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	VHR2	P40041	505 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	NST1	P53935	1240 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	ATG20	Q07528	640 aa		6.03	□□□□□ -1.44
YNL057W	YNL057W	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	PFF1	P38244	976 aa		6.02	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.02	□□□□□ -1.45	not detected
YNL057W	YNL057W	YAP5	P40574	245 aa		6.01	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	POM152	P39685	1337 aa		6	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	TFA1	P36100	482 aa		6	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	SHC1	P39000	512 aa		6	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	TEA1	P47988	759 aa		6	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	AUS1	Q08409	1394 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	YKU70	P32807	602 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	MAC1	P35192	417 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	HIM1	Q06674	414 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	IRC3	Q06683	689 aa		5.99	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	FKH1	P40466	484 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	ERO1	Q03103	563 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	NUP145	P49687	1317 aa		5.98	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	GRX4	P32642	244 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	YIL089W	P40500	205 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	not detected
YNL057W	YNL057W	VNX1	P42839	908 aa		5.97	□□□□□ -1.45
YNL057W	YNL057W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	RTG3	P38165	486 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	FET4	P40988	552 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	RMT2	Q03305	412 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	BDF2	Q07442	638 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	AIM7	Q12156	149 aa		5.96	□□□□□ -1.46
YNL057W	YNL057W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 38.4 ms