RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	GAL11	P19659	1081 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	MAM3	Q12296	706 aa		7.08	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	KRE5	P22023	1365 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	CFT1	Q06632	1357 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	USO1	P25386	1790 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	FKH1	P40466	484 aa		7.07	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	MGA2	P40578	1113 aa		7.06	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	7.05	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	YMR196W	Q04336	1088 aa		7.05	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	PLP2	Q12017	286 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	HOS4	P40480	1083 aa		7.04	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	PPH3	P32345	308 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	YAF9	P53930	226 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	GRX3	Q03835	250 aa		7.03	□□□□□ -1.28
GPT2	YKR067W	SEC20	P28791	383 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RCM1	P53972	490 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	YPR148C	Q06523	435 aa		7.02	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RIA1	P53893	1110 aa		7.01	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RRN6	P32786	894 aa		7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	TOM20	P35180	183 aa		7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	RRP46	P53256	223 aa	Predicted RBP	7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	PSK2	Q08217	1101 aa		7	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	HAP1	P0CE41	1502 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	YDL144C	Q07589	356 aa		6.99	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	SNF2	P22082	1703 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	MEH1	Q02205	184 aa		6.97	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	THI12	P42883	340 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	THI5	P43534	340 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	THI11	P47183	340 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	CST9	Q06032	482 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	HIM1	Q06674	414 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	YDL121C	Q07541	149 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	THI13	Q07748	340 aa		6.96	□□□□□ -1.29
GPT2	YKR067W	KIN1	P13185	1064 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	BOI2	P39969	1040 aa		6.96	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	6.95	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	CDC45	Q08032	650 aa		6.95	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	PSK1	P31374	1356 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	PKH1	Q03407	766 aa		6.94	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	AUS1	Q08409	1394 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	SCT1	P32784	759 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	TPM2	P40414	161 aa		6.93	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	CPS1	P27614	576 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	SLD2	P34252	453 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	ERP2	P39704	215 aa		6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	YNR029C	P53729	429 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	NFU1	P32860	256 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	YGL015C	P33199	130 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	CDC27	P38042	758 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	SAP155	P43612	1002 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	KEX1	P09620	729 aa		6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	VPS70	P47161	811 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	GDE1	Q02979	1223 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	THI22	Q06490	572 aa		6.9	□□□□□ -1.3
GPT2	YKR067W	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	CST6	P40535	587 aa		6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	KAR2	P16474	682 aa	Known RBP	6.89	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	MCM1	P11746	286 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	RSM7	P47150	247 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	PRD1	P25375	712 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	HEM3	P28789	327 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	TPD3	P31383	635 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	SEC9	P40357	651 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	GAS4	Q08271	471 aa		6.88	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	YIL177C	P40434	1758 aa		6.87	□□□□□ -1.31
GPT2	YKR067W	YJL225C	P40889	1758 aa		6.87	□□□□□ -1.31

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.6 ms