RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeastyeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
THP2YHR167W KXD1P53158 218 aa6.65□□□□□ -1.34
THP2YHR167W YJL007CP47080 104 aa6.64□□□□□ -1.35
THP2YHR167W YPR097WQ06839 1073 aa6.64□□□□□ -1.35
THP2YHR167W BIM1P40013 344 aa6.63□□□□□ -1.35
THP2YHR167W HXT10P43581 546 aa6.63□□□□□ -1.35
THP2YHR167W YJR115WP47152 169 aa6.63□□□□□ -1.35
THP2YHR167W TPD3P31383 635 aa6.62□□□□□ -1.35
THP2YHR167W ATG32P40458 529 aa6.62□□□□□ -1.35
THP2YHR167W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
THP2YHR167W ALR1Q08269 859 aa6.62□□□□□ -1.35
THP2YHR167W YDL176WQ12027 708 aa6.61□□□□□ -1.35
THP2YHR167W SPT5P27692 1063 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
THP2YHR167W SUP45P12385 437 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
THP2YHR167W YDJ1P25491 409 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
THP2YHR167W NAF1P53919 492 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
THP2YHR167W YNL108CP53929 270 aa6.58□□□□□ -1.36
THP2YHR167W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
THP2YHR167W RLF2Q12495 606 aa6.57□□□□□ -1.36
THP2YHR167W TIF1P10081 395 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
THP2YHR167W FIG4P42837 879 aa6.56□□□□□ -1.36
THP2YHR167W ENO2P00925 437 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
THP2YHR167W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
THP2YHR167W TEC1P18412 486 aa6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W VAC17P25591 423 aa6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W KIP2P28743 706 aa6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W YPR084WQ06821 456 aa6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W MCM16Q12262 181 aa6.53□□□□□ -1.36
THP2YHR167W UGA3P26370 528 aa6.51□□□□□ -1.37
THP2YHR167W IXR1P33417 597 aa6.51□□□□□ -1.37
THP2YHR167W PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
THP2YHR167W RIM21P48565 533 aa6.51□□□□□ -1.37
THP2YHR167W RTG2P32608 588 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
THP2YHR167W ISF1P32488 338 aa6.49□□□□□ -1.37
THP2YHR167W CAF120P53836 1060 aa6.49□□□□□ -1.37
THP2YHR167W MRX10Q05648 414 aa6.49□□□□□ -1.37
THP2YHR167W FRA1Q07825 749 aa6.49□□□□□ -1.37
THP2YHR167W YPR204WQ08995 1032 aa6.49□□□□□ -1.37
THP2YHR167W ENO1P00924 437 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
THP2YHR167W GUT2P32191 649 aa6.48□□□□□ -1.37
THP2YHR167W EMP47P43555 445 aa6.47□□□□□ -1.37
THP2YHR167W YPP1P46951 817 aa6.47□□□□□ -1.37
THP2YHR167W ITT1Q04638 464 aa6.47□□□□□ -1.37
THP2YHR167W OPT2Q06593 877 aa6.47□□□□□ -1.37
THP2YHR167W RDS2P19541 446 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
THP2YHR167W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
THP2YHR167W STE20Q03497 939 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
THP2YHR167W SRF1Q12516 437 aa6.46□□□□□ -1.38
THP2YHR167W TTI1P36097 1038 aa6.44□□□□□ -1.38
THP2YHR167W APL6P46682 809 aa6.44□□□□□ -1.38
THP2YHR167W MRX12P47084 519 aa6.44□□□□□ -1.38
THP2YHR167W PEP12P32854 288 aa6.41□□□□□ -1.38
THP2YHR167W CPS1P27614 576 aa6.4□□□□□ -1.38
THP2YHR167W ACO2P39533 789 aa6.4□□□□□ -1.38
THP2YHR167W EMW1P42842 904 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
THP2YHR167W APP1P53933 587 aa6.4□□□□□ -1.38
THP2YHR167W SIS2P36024 562 aa6.38□□□□□ -1.39
THP2YHR167W YIR007WP40566 764 aa6.38□□□□□ -1.39
THP2YHR167W NUP85P46673 744 aa6.38□□□□□ -1.39
THP2YHR167W GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W YBL086CP38177 466 aa6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W SOH1P38633 127 aa6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W ATG3P40344 310 aa6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W AAD14P42884 376 aa6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W UTP13Q05946 817 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
THP2YHR167W DLD1P32891 587 aa6.36□□□□□ -1.39
THP2YHR167W HAL5P38970 855 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
THP2YHR167W YLR346CQ06139 101 aa6.36□□□□□ -1.39
THP2YHR167W TY1A-BLQ12266 440 aa6.36□□□□□ -1.39
THP2YHR167W MIP1P15801 1254 aa6.35□□□□□ -1.39
THP2YHR167W SSA4P22202 642 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
THP2YHR167W SCW11P53189 542 aa6.35□□□□□ -1.39
THP2YHR167W SUB2Q07478 446 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
THP2YHR167W ATG20Q07528 640 aa6.35□□□□□ -1.39
THP2YHR167W ISR1Q06098 443 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
THP2YHR167W MKS1P34072 584 aa6.33□□□□□ -1.4
THP2YHR167W TGL4P36165 910 aa6.33□□□□□ -1.4
THP2YHR167W PUP1P25043 261 aa6.32□□□□□ -1.4
THP2YHR167W FBP26P32604 452 aa6.32□□□□□ -1.4
THP2YHR167W KTR7P40504 517 aa6.32□□□□□ -1.4
THP2YHR167W YGR035CP53222 116 aa6.32□□□□□ -1.4
THP2YHR167W ARG82P07250 355 aa6.31□□□□□ -1.4
THP2YHR167W YJR098CP47139 656 aa6.31□□□□□ -1.4
THP2YHR167W NOB1Q08444 459 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
THP2YHR167W LSC2P53312 427 aa6.3□□□□□ -1.4
THP2YHR167W ISU1Q03020 165 aa6.3□□□□□ -1.4
THP2YHR167W DFG5Q05031 458 aa6.3□□□□□ -1.4
THP2YHR167W HPF1Q05164 967 aa6.3□□□□□ -1.4
THP2YHR167W STE6P12866 1290 aa6.29□□□□□ -1.4
THP2YHR167W RTT106P40161 455 aa6.29□□□□□ -1.4
THP2YHR167W YML083CQ04526 418 aa6.29□□□□□ -1.4
THP2YHR167W TCB1Q12466 1186 aa6.29□□□□□ -1.4
THP2YHR167W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
THP2YHR167W GAL2P13181 574 aa6.28□□□□□ -1.4
THP2YHR167W HDA3Q06623 655 aa6.28□□□□□ -1.4
THP2YHR167W CBC2Q08920 208 aaKnown RBP RIP-Chip data6.28□□□□□ -1.4not detected
THP2YHR167W PHO87P25360 923 aa6.27□□□□□ -1.41
THP2YHR167W TRK2P28584 889 aa6.26□□□□□ -1.41
THP2YHR167W UTR2P32623 467 aa6.26□□□□□ -1.41
THP2YHR167W ACS2P52910 683 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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