RNA–Protein interactions for RNA: YGL239C

YGL239C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YGL239C, Length 315 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGL239C	YGL239C	FIG4	P42837	879 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	TEC1	P18412	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	BIO2	P32451	375 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	YNL108C	P53929	270 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	MTC5	Q03897	1148 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	CDC4	P07834	779 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	BIM1	P40013	344 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YGL239C	YGL239C	ISF1	P32488	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	ATG32	P40458	529 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	APP1	P53933	587 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	MET32	Q12041	191 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	GUT2	P32191	649 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	ASH1	P34233	588 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	RPL34B	P40525	121 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	EMP47	P43555	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	HST3	P53687	447 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	YPR084W	Q06821	456 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	MCM16	Q12262	181 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	TIF1	P10081	395 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	AFT1	P22149	690 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	RTG2	P32608	588 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	BRE2	P43132	505 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	UGA3	P26370	528 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	EMW1	P42842	904 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	FRA1	Q07825	749 aa		4.1	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	YPP1	P46951	817 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.09	□□□□□ -1.75
YGL239C	YGL239C	MKS1	P34072	584 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	YJR115W	P47152	169 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	RIM21	P48565	533 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ATG20	Q07528	640 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ENV9	Q08651	330 aa		4.08	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ENO1	P00924	437 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	YBL086C	P38177	466 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	SOH1	P38633	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	MRX12	P47084	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	DFG5	Q05031	458 aa		4.07	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	SRF1	Q12516	437 aa		4.06	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	FBP26	P32604	452 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ATG3	P40344	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	MRX10	Q05648	414 aa		4.05	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	APL6	P46682	809 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ISU1	Q03020	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	BDS1	Q08347	646 aa		4.04	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	ARG82	P07250	355 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	HAL5	P38970	855 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	RTT106	P40161	455 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	KTR7	P40504	517 aa		4.03	□□□□□ -1.76
YGL239C	YGL239C	STE6	P12866	1290 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	AAD14	P42884	376 aa		4.02	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	MIP1	P15801	1254 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	CPS1	P27614	576 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	DLD1	P32891	587 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	RLF2	Q12495	606 aa		4.01	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	MET22	P32179	357 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	UTR2	P32623	467 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	TTI1	P36097	1038 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	NUP85	P46673	744 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	HDA3	Q06623	655 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4	□□□□□ -1.77	not detected
YGL239C	YGL239C	WTM2	Q12206	467 aa		4	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	PEP12	P32854	288 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	TBS1	P38114	1094 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	LSC2	P53312	427 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	YDR444W	Q04093	687 aa		3.99	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	SIS2	P36024	562 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	OPT2	Q06593	877 aa		3.98	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	UTP7	P40055	554 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	YJR098C	P47139	656 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	YLR346C	Q06139	101 aa		3.97	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
YGL239C	YGL239C	TGL4	P36165	910 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	ECM23	Q02710	187 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	TCB1	Q12466	1186 aa		3.96	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SWI5	P08153	709 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	NTH2	P35172	780 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	SLX8	P40072	274 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	YFL034W	P43564	1073 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	TSC13	Q99190	310 aa		3.95	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78
YGL239C	YGL239C	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	3.94	□□□□□ -1.78

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