RNA–Protein interactions for RNA: YGL093W

SPC105, Transcript of Subunit of a kinetochore-microtubule binding complex, yeastyeast

Gene SPC105, Length 2,754 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC105YGL093W COBP00163 385 aa5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RAD4P14736 754 aa5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W OSM1P21375 501 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W KCC4P25389 1037 aa5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RTR1P40084 226 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RPN11P43588 306 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W NST1P53935 1240 aa5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W ADE16P54113 591 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W ALD2P47771 506 aa5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RIM15P43565 1770 aa5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W PRD1P25375 712 aa5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W HSP104P31539 908 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RRP46P53256 223 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W NSE3Q05541 303 aa5.26□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W BDF1P35817 686 aa5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W VPS27P40343 622 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data5.25□□□□□ -1.57not detected
SPC105YGL093W MSB4Q12317 492 aa5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W UGA2P38067 497 aa5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W NPR2P39923 615 aa5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W CDC45Q08032 650 aa5.25□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W UTP22P53254 1237 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W YBP2P53169 641 aa5.23□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W ZDS1P50111 915 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W RMT2Q03305 412 aa5.23□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W ALD3P54114 506 aa5.22□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W YDL144CQ07589 356 aa5.22□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W GYP7P48365 746 aa5.22□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W PHM7Q12252 991 aa5.22□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W SSP2Q08646 371 aa5.21□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W BUG1Q12191 341 aa5.21□□□□□ -1.57
SPC105YGL093W SSA2P10592 639 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W YBL086CP38177 466 aa5.21□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W THI22Q06490 572 aa5.21□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W MPP10P47083 593 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W HEF3P53978 1044 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W DIB1Q06819 143 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W SSK22P25390 1331 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W SAP155P43612 1002 aa5.18□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W CTH1P47976 325 aa5.18□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data5.18□□□□□ -1.58not detected
SPC105YGL093W YJR008WP47085 338 aa5.18□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W YOL057WQ08225 711 aa5.18□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W LYS4P49367 693 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data5.17□□□□□ -1.58not detected
SPC105YGL093W UTP10P42945 1769 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W RPS9BP05755 195 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W RPG1P38249 964 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W DNM1P54861 757 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W RTT109Q07794 436 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W NYV1Q12255 253 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W TPD3P31383 635 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W TOS1P38288 455 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W SUI2P20459 304 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W PRS1P32895 427 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W RRT14P40470 206 aa5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W HGH1P48362 394 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W COQ4O13525 335 aa5.15□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data5.15□□□□□ -1.58not detected
SPC105YGL093W RAT1Q02792 1006 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.58
SPC105YGL093W CST6P40535 587 aa5.15□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YLR271WQ06152 274 aa5.15□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W ALE1Q08548 619 aa5.15□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YDR306CQ06640 478 aa5.14□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YPP1P46951 817 aa5.14□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SRT1Q03175 343 aa5.14□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W TEA1P47988 759 aa5.13□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SUP35P05453 685 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W RAD2P07276 1031 aa5.12□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W PFF1P38244 976 aa5.12□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W LPD1P09624 499 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W MRP7P12687 371 aa5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W HAT1Q12341 374 aa5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W RPS19AP07280 144 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W RPS19BP07281 144 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YKL222CP35995 705 aa5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YPR204WQ08995 1032 aa5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SAC3P46674 1301 aa5.11□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W CTT1P06115 562 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W ARG8P18544 423 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W ERT1P38140 529 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W HPC2Q01448 625 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W MTC5Q03897 1148 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SWI1P09547 1314 aa5.1□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W DAL5P15365 543 aa5.09□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SIT4P20604 311 aa5.09□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W YIL092WP40497 633 aa5.09□□□□□ -1.59
SPC105YGL093W SER1P33330 395 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.6
SPC105YGL093W ERO1Q03103 563 aa5.09□□□□□ -1.6
SPC105YGL093W SYF1Q04048 859 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
SPC105YGL093W UBX2Q04228 584 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms