RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	RSC30	P38781	883 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	MVP1	P40959	511 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.24	□□□□□ -1.57	not detected
SYF1	YDR416W	MET4	P32389	672 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	NUT2	Q06213	157 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	VPS16	Q03308	798 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	PIN2	Q12057	282 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	GUT1	P32190	709 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	FYV10	P40492	516 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	SSK2	P53599	1579 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	BOL3	P39724	118 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	TY4A-J	P47023	414 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	ATH1	P48016	1211 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	FRT1	Q99332	602 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	GAL11	P19659	1081 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.22	□□□□□ -1.57	not detected
SYF1	YDR416W	ACF4	P47129	309 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	BPT1	P14772	1559 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	SIT4	P20604	311 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	MNN1	P39106	762 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	MAD1	P40957	749 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	PNP1	Q05788	311 aa		5.21	□□□□□ -1.57
SYF1	YDR416W	HIR3	P47171	1648 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	BOI2	P39969	1040 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SCY1	P53009	804 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	NAF1	P53919	492 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	VMA4	P22203	233 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	YJR142W	P47173	342 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	YOR238W	Q08634	303 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.2	□□□□□ -1.58	not detected
SYF1	YDR416W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	GRE2	Q12068	342 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	UBP12	P39538	1254 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	YOR131C	Q12486	218 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	KAR1	P11927	433 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	QDR1	P40475	563 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	BDF2	Q07442	638 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MCM16	Q12262	181 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	GAP1	P19145	602 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	CLN2	P20438	545 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	GRX7	P38068	203 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	GLO3	P38682	493 aa	Known RBP	5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	AIM21	P40563	679 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	EMP47	P43555	445 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	RMD1	Q03441	430 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SOL3	P38858	249 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	ERP2	P39704	215 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SRS2	P12954	1174 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MIP1	P15801	1254 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	TOA1	P32773	286 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	DNM1	P54861	757 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SPR28	Q04921	423 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	YPR109W	Q06104	294 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	ENV9	Q08651	330 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	PHO87	P25360	923 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SEC6	P32844	805 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	RAD2	P07276	1031 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MCM2	P29469	868 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	RTT106	P40161	455 aa		5.15	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.58
SYF1	YDR416W	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	HAP4	P14064	554 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ISW1	P38144	1129 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	YEN1	P40028	759 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ROM1	P53046	1155 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	CSC1	Q06538	782 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PUN1	Q06991	263 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	NKP1	Q12493	238 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	SGS1	P35187	1447 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ATG2	P53855	1592 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	TAT2	P38967	592 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	MTO1	P53070	669 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	ITC1	P53125	1264 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	YOL036W	Q08206	761 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SYF1	YDR416W	PHO4	P07270	312 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59

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