RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	FMN1	Q68DA7	1419 aa		7	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	GRIN2B	Q13224	1484 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGEF11	O15085	1522 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	CUL7	Q14999	1698 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD9	Q5K651	1589 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	TOPBP1	Q92547	1522 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	ANP32C	O43423	234 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	IER5L	Q5T953	404 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	BCAN	Q96GW7	911 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA2	Q15596	1464 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ATXN3-212	ENST00000515746	AKNA	Q7Z591	1439 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	NEFL	P07196	543 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	P3H3	Q8IVL6	736 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	OTUD5	Q96G74	571 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	TONSL	Q96HA7	1378 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	OCEL1	Q9H607	264 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	TRIM52	Q96A61	297 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	SEC24B	O95487	1268 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	C7	P10643	843 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	PLCG2	P16885	1265 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC39A7	Q92504	469 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		6.92	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	NCOA1	Q15788	1441 aa		6.91	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	HECW1	Q76N89	1606 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	6.9	□□□□□ -1.3
ATXN3-212	ENST00000515746	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		6.9	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	6.9	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEB2	H3BUK9	544 aa		6.89	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR70	Q9NW82	654 aa		6.89	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	NES	P48681	1621 aa		6.89	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		6.89	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	KDM6B	O15054	1643 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	MIA2	Q96PC5	1412 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL11A	Q9H165	835 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	METRN	Q9UJH8	293 aa		6.88	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	ROCK1	Q13464	1354 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	POTEF	A5A3E0	1075 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746		G3V3G9	751 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	PDE4A	P27815	886 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	MICALL2	Q8IY33	904 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		6.87	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR62	O43379	1518 aa		6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	6.86	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC184	Q52MB2	194 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		6.85	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	MBD5	Q9P267	1494 aa		6.84	□□□□□ -1.31
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		6.83	□□□□□ -1.32
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC5	O15440	1437 aa		6.83	□□□□□ -1.32
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	6.82	□□□□□ -1.32

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