RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360954.2

HS3ST3B1-201, Transcript of heparan sulfate-glucosamine 3-sulfotransferase 3B1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HS3ST3B1, Length 5,367 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MIA2Q96PC5 1412 aa20.4■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 E9PSI1 815 aa20.4■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa20.4■□□□□ 0.86
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.39■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLCB2Q00722 1185 aa20.39■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EFCAB5A4FU69 1503 aa20.38■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRAK1Q9UPV9 953 aa20.38■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CFTRP13569 1480 aa20.37■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GRIN2BQ13224 1484 aa20.37■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MSNP26038 577 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AMPHP49418 695 aa20.35■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.33■□□□□ 0.85
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.33■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NCOA2Q15596 1464 aa20.33■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 COG3Q96JB2 828 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HMGXB3Q12766 1538 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 OSCARQ8IYS5 282 aa20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APBB1O00213 710 aa20.3■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AAMPQ13685 434 aa20.28■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC7Q96M83 1385 aa20.27■□□□□ 0.84
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CCDC34Q96HJ3 373 aa20.26■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.26■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CNTLNQ9NXG0 1405 aa20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ST18O60284 1047 aa20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 USP35Q9P2H5 1018 aa20.25■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TOP2BQ02880 1626 aa20.24■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYNJ2O15056 1496 aa20.24■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GORABQ5T7V8 394 aa20.24■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.24■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.24■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF3AQ9Y496 699 aa20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 FAM161AQ3B820 660 aa20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRXQ9BXM0 1461 aa20.23■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa20.22■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DRC7Q8IY82 874 aa20.22■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PRDM2Q13029 1718 aa20.22■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SYNJ1O43426 1573 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HFM1A2PYH4 1435 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 IFT140Q96RY7 1462 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAF7LQ5H9L4 462 aa20.21■□□□□ 0.83
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ROCK1Q13464 1354 aa20.2■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARAP1Q96P48 1450 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TPM4P67936 248 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.19■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF7Q2M1P5 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 WASHC2AQ641Q2 1341 aa20.18■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PHF14O94880 888 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RUNDC1Q96C34 613 aa20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ARHGAP5Q13017 1502 aa20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 APAF1O14727 1248 aa20.14■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 PDE4AP27815 886 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 HECW1Q76N89 1606 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 KIF16BQ96L93 1317 aa20.13■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TEFQ10587 303 aa20.11■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 TOPBP1Q92547 1522 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 CRBNQ96SW2 442 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.1■□□□□ 0.81
HS3ST3B1-201ENST00000360954 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 830.3 ms