RNA–Protein interactions for RNA: YOR063W

RPL3, Transcript of Ribosomal 60S subunit protein L3, yeast

Gene RPL3, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPL3	YOR063W	YKL018C-A	Q3E7A7	99 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	UGA1	P17649	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	URA4	P20051	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ATP11	P32453	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
RPL3	YOR063W	MRPL17	P36528	281 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	PIM1	P36775	1133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SOL2	P37262	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ROT2	P38138	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RRF1	P38771	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	FAD1	P38913	306 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ATF1	P40353	525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MEP2	P41948	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	FMP32	P43557	207 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	COG7	P53195	279 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SKO1	Q02100	647 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YDR124W	Q04608	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	BCH1	Q05029	724 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MUM3	Q08750	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ELO2	P25358	347 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	IML3	P38265	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MDE1	P47095	244 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YGR149W	P48236	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	GTO1	P48239	356 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MRK1	P50873	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SUN4	P53616	420 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MET31	Q03081	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RSM10	Q03201	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	EMI1	Q04406	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	GMC2	Q06201	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CYK3	Q07533	885 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	COS7	Q07788	383 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ULA1	Q12059	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MHT1	Q12525	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	HFA1	P32874	2273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	THP2	O13539	261 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	STE3	P06783	470 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CHO1	P08456	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RSR1	P13856	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SKG1	P36169	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	BMT2	P38278	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	UBA4	P38820	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	FAA2	P39518	744 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	AYR1	P40471	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	KEL2	P50090	882 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YGR015C	P53208	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SWS2	P53937	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MPS1	P54199	764 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MSC1	Q03104	513 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	PFA5	Q03289	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	CCE1	Q03702	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ECM11	Q04110	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ACF2	Q12168	779 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YOR342C	Q12182	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YDR061W	Q12298	539 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	PSY3	Q12318	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SRN2	Q99176	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RAP1	P11938	827 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SNF4	P12904	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ATO2	P32907	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	TAE1	P38340	232 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	ATG7	P38862	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YHR218W	P38899	603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	MTW1	P39731	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SER3	P40054	469 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	SNL1	P40548	159 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	NBP35	P52920	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	RMR1	P53060	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	YNL260C	P53846	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPL3	YOR063W	AQR1	P53943	586 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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