RNA–Protein interactions for RNA: YMR085W

YMR085W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YMR085W, Length 1,299 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR085W	YMR085W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
YMR085W	YMR085W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	MSS51	P32335	436 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SUA5	P32579	426 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	MRPL3	P36516	390 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YPK3	P38070	525 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SHG1	P38337	142 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ERV46	P39727	415 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PHM8	P40025	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	CFD1	P40558	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	GNA1	P43577	159 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	DIA3	P52290	468 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	INN1	P53901	409 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	OCA2	P53949	197 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PRM15	Q03262	622 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SLD5	Q03406	294 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YMR155W	Q03795	547 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YLR283W	Q05867	314 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	BCP1	Q06338	283 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	MFG1	Q07684	458 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	LCB4	Q12246	624 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ATP14	Q12349	124 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	AGC1	Q12482	902 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	USO1	P25386	1790 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	COS2	P0CX12	379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	COS3	P0CX13	379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	CCA1	P21269	546 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SHP1	P34223	423 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	VID24	P38263	362 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	POP4	P38336	279 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	GOS1	P38736	223 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SEO1	P39709	593 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	EXO1	P39875	702 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RMD6	P39975	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ECM10	P39987	644 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	NAS2	P40555	220 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YIR035C	P40579	254 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SSU1	P41930	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PTR3	P43606	678 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SNG1	P46950	547 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	IRC8	P47046	822 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	NBP35	P52920	328 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SWC4	P53201	476 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PEX25	Q02969	394 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	LDB18	Q07887	179 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YNG1	Q08465	219 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YPL150W	Q12152	901 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	FRE7	Q12333	620 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RTN2	Q12443	393 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PDX1	P16451	410 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	MRPL44	P19956	98 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	BOS1	P25385	244 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	DCC1	P25559	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	MDL1	P33310	695 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	SPO23	P33757	523 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RPC25	P35718	212 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YBR137W	P38276	179 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ATG7	P38862	630 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	UIP3	P39547	235 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	RBG1	P39729	369 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	FAU1	P40099	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YNL320W	P42840	284 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YFL015C	P43578	164 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	IRC7	P43623	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	FAR3	P46671	204 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	USE1	P53146	245 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	ERV14	P53173	138 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YTP1	P53584	459 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YNL181W	P53878	407 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	VPS9	P54787	451 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YMR085W	YMR085W	YCL001W-A	P87012	153 aa		4.12	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.9 ms