RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	ORC5	P50874	479 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	BUR2	Q05949	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	GEP3	Q08622	556 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.75	not detected
KTR2	YKR061W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.09	□□□□□ -1.75
KTR2	YKR061W	SPE1	P08432	466 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CTR86	P25355	563 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	QDR3	P38227	689 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PCA1	P38360	1216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SBE22	P38814	852 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	FMO1	P38866	432 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CIN4	P39110	191 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	HAT2	P39984	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SWP82	P43554	623 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TAX4	P47030	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPC17	P47076	161 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YGL108C	P53139	140 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YGR079W	P53249	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASI2	P53895	289 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
KTR2	YKR061W	MMT1	Q03218	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PEX10	Q05568	337 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ORM2	Q06144	216 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ARR3	Q06598	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CYK3	Q07533	885 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TPO1	Q07824	586 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CSM4	Q08955	156 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ECM3	Q99252	613 aa		4.08	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YLR415C	O13578	112 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	QCR7	P00128	127 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SCEI	P03882	235 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CHS1	P08004	1131 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RIP1	P08067	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YMR31	P19955	123 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GAC1	P28006	793 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	MSK1	P32048	576 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	VPH2	P32341	215 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	NDC1	P32500	655 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YKL063C	P35725	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YPK3	P38070	525 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RRN10	P38204	145 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YHR112C	P38716	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GPI16	P38875	610 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ELO1	P39540	310 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YER186C	P40101	306 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YNL194C	P40169	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	JLP2	P40206	208 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YMR134W	P40207	237 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ATG27	P46989	271 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YGR168C	P53293	376 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SPC98	P53540	846 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YIP3	P53633	176 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	FYV6	P53913	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YDC1	Q02896	317 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	AFT2	Q08957	416 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GRE1	Q08969	168 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ATG9	Q12142	997 aa		4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	PPZ1	P26570	692 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	RPC34	P32910	317 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	CSE2	P33308	149 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	SDH8	P38345	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	INM1	P38710	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	TDA11	P38854	504 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	FRT2	P39734	528 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	YER121W	P40076	114 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	DSE1	P40077	573 aa		4.06	□□□□□ -1.76
KTR2	YKR061W	GAT2	P40209	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.9 ms