RNA–Protein interactions for RNA: YJR147W

HMS2, Transcript of Protein with similarity to heat shock transcription factors, yeast

Gene HMS2, Length 1,077 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HMS2	YJR147W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AHC2	P25649	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CTS1	P29029	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ERG9	P29704	444 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	HXT4	P32467	576 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MDL2	P33311	773 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YKL070W	P36087	169 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YKR075C	P36155	307 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TAT1	P38085	619 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	POA1	P38218	177 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ECM8	P38246	354 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PUG1	P40100	303 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FMC1	P40491	155 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	GAB1	P41733	394 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YGL204C	P53089	101 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	DIA1	P54005	336 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	KIN4	Q01919	800 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CDC123	Q05791	360 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ADY4	Q05955	493 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	REX4	Q08237	289 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	DCI1	Q08558	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	THI72	Q08579	599 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YPL257W	Q08974	193 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.24	□□□□□ -1.41	not detected
HMS2	YJR147W	PNS1	Q12412	539 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	COA6	Q3E846	104 aa		6.24	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PRC1	P00729	532 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PPZ1	P26570	692 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YUR1	P26725	428 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AEP1	P32493	518 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MAC1	P35192	417 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RIM2	P38127	377 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FIG1	P38224	298 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FMO1	P38866	432 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	JHD1	P40034	492 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YIL054W	P40524	105 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NSE4	P43124	402 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SIP4	P46954	829 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRX5	P47007	382 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YGL101W	P53144	215 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YNL033W	P53964	284 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YNL019C	P53975	284 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NUP49	Q02199	472 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PRM6	Q04705	352 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FRQ1	Q06389	190 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CUR1	Q06469	252 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	CDD1	Q06549	142 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RAD34	Q06665	692 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RFU1	Q08003	200 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PEX27	Q08580	376 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	HFI1	Q12060	488 aa		6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AI1	P03875	834 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SPS2	P08459	502 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MAS2	P11914	482 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FUN14	P18411	198 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	COQ1	P18900	473 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MRPL9	P31334	269 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.22	□□□□□ -1.41	not detected
HMS2	YJR147W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SOL2	P37262	315 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SRO77	P38163	1010 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	MSC7	P38694	644 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	ARN1	P38731	627 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RBG1	P39729	369 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	PEP8	P40335	379 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	POG1	P40473	351 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	GAT1	P43574	510 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	AMA1	P50082	593 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	YGL159W	P53110	370 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TRS31	Q03337	283 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	FDH1	Q08911	376 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	NMD4	Q12129	218 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	INP53	Q12271	1107 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	RMD5	Q12508	421 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		6.22	□□□□□ -1.41
HMS2	YJR147W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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