RNA–Protein interactions for RNA: YJL215C

YJL215C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YJL215C, Length 360 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YJL215C	YJL215C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	POP6	P53218	158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	MRP51	Q02950	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	FUS2	Q05670	677 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	IPK1	Q06667	281 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	TIM18	Q08749	192 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YPR202W	Q08993	238 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PSY3	Q12318	242 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	HRT3	Q12347	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	TEF1	P02994	458 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	CHS1	P08004	1131 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RSR1	P13856	272 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	QDR3	P38227	689 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YBR242W	P38331	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	VAB2	P40003	282 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	FCY21	P40039	528 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	MKT1	P40850	830 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	GCD10	P41814	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	FMP32	P43557	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	GLG2	P47011	380 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RTT101	P47050	842 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	AVT4	P50944	713 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	NUP84	P52891	726 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RMR1	P53060	241 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	AQR1	P53943	586 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	URC2	Q04411	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YMR321C	Q04898	105 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	BBP1	Q12365	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	KSS1	P14681	368 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	CDC23	P16522	626 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	VPS3	P23643	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RRT12	P25381	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YCR022C	P25620	114 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	MGT1	P26188	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YUR1	P26725	428 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YSC83	P32792	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RCN1	P36054	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	ETR1	P38071	380 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YBP1	P38315	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	LAA1	P39526	2014 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PHB2	P50085	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	CAF40	P53829	373 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	STD1	Q02794	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PIR3	Q03180	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	SPC2	Q04969	178 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	IMA2	Q08295	589 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	YPL199C	Q08954	240 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RMD5	Q12508	421 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YJL215C	YJL215C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	SMF2	P38778	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	PES4	P39684	611 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	YJL070C	P40361	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	SER33	P40510	469 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	NAS2	P40555	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	YGR266W	P53326	701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	ARK1	P53974	638 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	YML122C	Q03207	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	GPI17	Q04080	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	SPH1	Q06160	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	GRS2	Q06817	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	REX3	Q12090	404 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	ERP3	Q12403	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
YJL215C	YJL215C	MRS3	P10566	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	NMT1	P14743	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	HSP30	P25619	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	SPR1	P32603	445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	PMU1	P36069	295 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	GOS1	P38736	223 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YJL215C	YJL215C	MST28	P39552	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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