RNA–Protein interactions for RNA: YJL030W

MAD2, Transcript of Component of the spindle-assembly checkpoint complex, yeast

Gene MAD2, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MAD2	YJL030W	RTC2	P38279	296 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	STD1	Q02794	444 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MMT1	Q03218	510 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	LDB17	Q12342	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	CYC3	P06182	269 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RSR1	P13856	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	PET123	P17558	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	KAR9	P32526	644 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.61	□□□□□ -1.67	not detected
MAD2	YJL030W	RPC25	P35718	212 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YHR122W	P38829	231 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	NDT80	P38830	627 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	JLP2	P40206	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	SIM1	P40472	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YGR210C	P42942	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	NCA3	P46955	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	SFH5	P47008	294 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	CGR1	P53188	120 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	HER2	Q03557	464 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	BCH1	Q05029	724 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RBD2	Q12270	262 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YDR262W	Q12331	272 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RGS2	Q99188	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MHP1	P43638	1398 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TY3B-I	Q7LHG5	1498 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YCL068C	P25593	260 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YPS1	P32329	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YOX1	P34161	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	DOA1	P36037	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	STP2	P38704	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YNL260C	P53846	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	URC2	Q04411	772 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	BOP2	Q06150	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YOL107W	Q12239	342 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TRP1	P00912	224 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RNA1	P11745	407 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YBR056W	P38081	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YHR177W	P38867	453 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RCY1	P39531	840 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	TOS3	P43637	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YGL185C	P53100	379 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RET3	P53600	189 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YNL050C	P53952	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	INP2	Q03824	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	ECM7	Q06200	448 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	RNH203	Q12338	110 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	YRM1	Q12340	786 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	FSH3	Q99369	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MAD2	YJL030W	QCR6	P00127	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	RPL12B	P0CX54	165 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	CLN3	P13365	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	CDC42	P19073	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	CIN8	P27895	1000 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	SPR1	P32603	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	COX13	P32799	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	MNS1	P32906	549 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	BUD2	P33314	1104 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
MAD2	YJL030W	GIM3	P53900	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	GPN3	Q06543	272 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	FMP16	Q12497	93 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	MER1	P16523	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	RAD23	P32628	398 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	SKN1	P33336	771 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	HRI1	Q05905	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	BUR2	Q05949	395 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	LDS2	Q08218	356 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MAD2	YJL030W	RAX1	Q08760	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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