RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	HMS1	Q12398	434 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	DNA2	P38859	1522 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPC17	YJL011C	VPS63	O13549	108 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MIR1	P23641	311 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ERG9	P29704	444 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	PMT2	P31382	759 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MYO3	P36006	1272 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	IML3	P38265	245 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YDR089W	P38966	869 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SSO2	P39926	295 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	BTT1	P40314	149 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	PGU1	P47180	361 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	TRM82	Q03774	444 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	REV3	P14284	1504 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	UNG1	P12887	359 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ZRC1	P20107	442 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	RCK2	P38623	610 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	FSH2	Q05015	223 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ALE1	Q08548	619 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MDY2	Q12285	212 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	COX4	P04037	155 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	IES6	P32617	166 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	UTH1	P36135	365 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SUR7	P54003	302 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	HAL1	Q01766	294 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	BUR2	Q05949	395 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YLR177W	Q06251	628 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	RPN6	Q12377	434 aa		3.5	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.49	□□□□□ -1.85	not detected
RPC17	YJL011C	LDS1	P31379	325 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	DEP1	P31385	405 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YPS1	P32329	569 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	WSC4	P38739	605 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	IGD1	P43598	195 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	AIM23	P47015	356 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	HIF1	Q12373	385 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SSK2	P53599	1579 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	STE7	P06784	515 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	PET18	P25362	215 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	TOA1	P32773	286 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SOL2	P37262	315 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	BIO3	P50277	480 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	CDH1	P53197	566 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ADD37	Q03233	198 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SCS7	Q03529	384 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YLR297W	Q05899	129 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	DDC1	Q08949	612 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ESP1	Q03018	1630 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SAL1	D6W196	494 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	DCC1	P25559	380 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SHE1	P38200	338 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	BMT2	P38278	337 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SWC5	P38326	303 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MMS21	P38632	267 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SMF2	P38778	549 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YNL320W	P42840	284 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MOB2	P43563	287 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YFR018C	P43599	363 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YJR054W	P47114	497 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	TAF6	P53040	516 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	YGR015C	P53208	328 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	VHT1	P53241	593 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	CAB5	Q03941	241 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	SIN3	P22579	1536 aa		3.47	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	ATG2	P53855	1592 aa		3.46	□□□□□ -1.85
RPC17	YJL011C	TAF2	P23255	1407 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	BUD2	P33314	1104 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	YKL162C	P36052	402 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	END3	P39013	349 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	YPS5	P53057	165 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	YGR168C	P53293	376 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	YDR115W	Q04598	105 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	GAS2	Q06135	555 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	CUR1	Q06469	252 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	TAF10	Q12030	206 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	KOG1	P38873	1557 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	COS9	P36034	407 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	DTR1	P38125	572 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	YBR241C	P38142	488 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	GPI18	P38211	433 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	RRF1	P38771	230 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	INA22	P40576	216 aa		3.45	□□□□□ -1.86
RPC17	YJL011C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86

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