RNA–Protein interactions for RNA: YHL004W

MRP4, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRP4, Length 1,185 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRP4	YHL004W	GTR2	P53290	341 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	IBD2	P53892	351 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RMI1	Q02685	241 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	URC2	Q04411	772 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YFT2	Q06676	274 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BAG7	Q12128	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PER33	Q12144	273 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	VAM3	Q12241	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YIM1	P28625	365 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	COX13	P32799	129 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	REC114	P32841	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PTM1	P32857	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
MRP4	YHL004W	TIP20	P33891	701 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MAL32	P38158	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TSC10	P38342	320 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SDH8	P38345	138 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MED6	P38782	295 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	COA1	P40452	197 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	VEL1	P53058	206 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	USE1	P53146	245 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SWC4	P53201	476 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SHY1	P53266	389 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MAL12	P53341	584 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MNT4	P53745	580 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DSL1	P53847	754 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	OSH6	Q02201	448 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TAF12	Q03761	539 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CAB5	Q03941	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	NDL1	Q06568	189 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MRPL35	Q06678	367 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	NSE1	Q07913	336 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	USV1	Q12132	391 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	INP53	Q12271	1107 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YOS9	Q99220	542 aa		4.06	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	FAB1	P34756	2278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RPN13	O13563	156 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MRP13	P12686	339 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SAG1	P20840	650 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	HIR2	P32480	875 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DBP8	P38719	431 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PAC2	P39937	518 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	LOH1	P47055	219 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	TOM22	P49334	152 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YGL185C	P53100	379 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ROG1	P53118	685 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YGL108C	P53139	140 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	OCA2	P53949	197 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	AAT1	Q01802	451 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	SRL4	Q03085	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RSN1	Q03516	953 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GOT1	Q03554	138 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	EKI1	Q03764	534 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BCH1	Q05029	724 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ARR3	Q06598	404 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GRS2	Q06817	618 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	OSW1	Q08692	278 aa		4.05	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ARG80	P07249	177 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PUT2	P07275	575 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MSF1	P08425	469 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	EPT1	P22140	391 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ATP7	P30902	174 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	MRPL9	P31334	269 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	FRE2	P36033	711 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ASC1	P38011	319 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ARP1	P38696	384 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	UBA4	P38820	440 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	OTU1	P43558	301 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	NAS6	P50086	228 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	EMC4	P53073	190 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	COG7	P53195	279 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	COG2	P53271	262 aa		4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
MRP4	YHL004W	ZRG17	P53735	605 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 23.4 ms