RNA–Protein interactions for RNA: YGL246C

RAI1, Transcript of Nuclear protein with decapping endonuclease activity, yeast

Gene RAI1, Length 1,164 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RAI1	YGL246C	DAP2	P18962	818 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	MSP1	P28737	362 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	PSO2	P30620	661 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	DEP1	P31385	405 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	KEG1	P43614	200 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	SLM3	Q12093	417 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RAI1	YGL246C	COX4	P04037	155 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	ZRC1	P20107	442 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	IES6	P32617	166 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	TIM17	P39515	158 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RET3	P53600	189 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	FRE6	Q12473	712 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RIM15	P43565	1770 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	GIT1	P25346	518 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	CAJ1	P39101	391 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	GPI8	P49018	411 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YPR078C	Q06813	372 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	GAT3	Q07928	141 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	PEX27	Q08580	376 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	HMS1	Q12398	434 aa		4.2	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SIR4	P11978	1358 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RPO41	P13433	1351 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	STE7	P06784	515 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MAS2	P11914	482 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	VAM7	P32912	316 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	GPI18	P38211	433 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	PES4	P39684	611 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	CIN2	P46670	268 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YGR016W	P53209	190 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YNR068C	P53754	272 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MRPS16	Q02608	121 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MCT1	Q12283	360 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.19	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MSK1	P32048	576 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	DPH2	P32461	534 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	PFS1	P38872	237 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SEC9	P40357	651 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YMR010W	Q03687	405 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MSC3	Q05812	728 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SHS1	Q07657	551 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	AUS1	Q08409	1394 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MID2	P36027	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	IGD1	P43598	195 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	YPS5	P53057	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MPS2	P53159	387 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	TLG1	Q03322	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SFM1	Q12314	213 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SPT7	P35177	1332 aa		4.17	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	HEM4	P06174	275 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	RDS1	P25611	832 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	VHT1	P53241	593 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	MKC7	P53379	596 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	SFG1	Q12507	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RAI1	YGL246C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	MEP1	P40260	492 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	SNL1	P40548	159 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	PGU1	P47180	361 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	VAC7	P53950	1165 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YLH47	Q06493	454 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YDL109C	Q12103	647 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	FSH3	Q99369	266 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	VHS1	Q03785	461 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	GRX3	Q03835	250 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	CMK2	P22517	447 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	LDS1	P31379	325 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RAI1	YGL246C	YKR015C	P36111	568 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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