RNA–Protein interactions for RNA: YAL063C

FLO9, Transcript of Lectin-like protein with similarity to Flo1p, yeast

Gene FLO9, Length 3,969 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FLO9	YAL063C	SWM2	P40342	146 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	HXT8	P40886	569 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ASG7	P46993	209 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	NUP57	P48837	541 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	BIO3	P50277	480 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	INN1	P53901	409 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	PKR1	Q03880	122 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	GMC1	Q04399	608 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SDH7	Q04401	133 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ECM30	Q06673	1274 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	FMP25	Q08023	583 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	THI20	Q08224	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	MED7	Q08278	222 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YLR108C	Q12259	485 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SPE4	Q12455	300 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ZRC1	P20107	442 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ERG9	P29704	444 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	UPS2	P35200	230 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	BNA4	P38169	460 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	GEP4	P38812	185 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	QDR1	P40475	563 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SBH2	P52871	88 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	FLC3	P53121	802 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YNL034W	P53963	612 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YNL018C	P53976	612 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	STD1	Q02794	444 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ARA2	Q04212	335 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	MRPL1	Q04599	285 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ATG39	Q06159	398 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SYT1	Q06836	1226 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	RRI1	Q12468	440 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SRF1	Q12516	437 aa		3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TIF6	Q12522	245 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	COX5B	P00425	151 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CDC6	P09119	513 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TIM23	P32897	222 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	DTR1	P38125	572 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TAE1	P38340	232 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
FLO9	YAL063C	MGS1	P40151	587 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	PHB2	P50085	310 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	AIF1	P52923	378 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YGR066C	P53242	292 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ALG11	P53954	548 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YDR366C	P87287	132 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	GIS1	Q03833	894 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	PUN1	Q06991	263 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TRM10	Q12400	293 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YDL199C	Q12407	687 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TFC7	Q12415	435 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	FLP1	P03870	423 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	VBA3	P25594	458 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	EHD3	P28817	500 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	HEM12	P32347	362 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	MRPL36	P36531	177 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	FLR1	P38124	548 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	EFM1	P38732	585 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YHR122W	P38829	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	PHO90	P39535	881 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ELO3	P40319	345 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YJR149W	P47177	404 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	COS10	P52924	374 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	DSD1	P53095	428 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	HXT15	P54854	567 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SHH3	Q04487	196 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CDD1	Q06549	142 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	IZH3	Q07959	543 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	THI72	Q08579	599 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TRM13	Q12383	476 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SLO1	Q3E784	85 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	RHO2	P06781	192 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YER152C	P10356	443 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	DAL82	P21705	255 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	STE50	P25344	346 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SNC1	P31109	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	SPR1	P32603	445 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	GAT2	P40209	560 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	POG1	P40473	351 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	AIM22	P47051	409 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YJR012C	P47087	207 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	MPA43	P53583	542 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YNR066C	P53752	436 aa		3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
FLO9	YAL063C	YDR222W	Q04925	415 aa		3.14	□□□□□ -1.91

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