RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481269.1

CSNK2B-208, Transcript of casein kinase 2 beta, human

TSL 2

Gene CSNK2B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSNK2B-208	ENST00000481269	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CTSH	P09668	335 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FOXC1	Q12948	553 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	AP3B2	Q13367	1082 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	NTRK3	Q16288	839 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KAT2B	Q92831	832 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	APBB2	Q92870	758 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	UST	Q9Y2C2	406 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PIK3CD	O00329	1044 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	EOMES	O95936	686 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PDE4D	Q08499	809 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	AFG1L	Q8WV93	481 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	STAM2	O75886	525 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	LARGE1	O95461	756 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GLUL	P15104	373 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GJB2	P29033	226 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KRT2	P35908	639 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PSEN2	P49810	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FUT2	Q10981	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CUL4A	Q13619	759 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KCNC3	Q14003	757 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CASP10	Q92851	521 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	IWS1	Q96ST2	819 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	NFIB	O00712	420 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	LILRB5	O75023	590 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	LRP3	O75074	770 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KCNK5	O95279	499 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ZNF76	P36508	570 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	HSD17B4	P51659	736 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ERVFC1	P60507	584 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	C19orf57	Q0VDD7	668 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	BLID	Q8IZY5	108 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	GATA6	Q92908	595 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RMDN3	Q96TC7	470 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	LRRN2	O75325	713 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	DGKI	O75912	1065 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RET	P07949	1114 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCND2	P30279	289 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	UBE3A	Q05086	875 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	MFSD10	Q14728	455 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	STXBP2	Q15833	593 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CCDC6	Q16204	474 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CSRP2	Q16527	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	MCTP1	Q6DN14	999 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	CDHR1	Q96JP9	859 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	FOXQ1	Q9C009	403 aa		12.78	□□□□□ -0.36
CSNK2B-208	ENST00000481269	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.36

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