RNA–Protein interactions for RNA: YOR348C

PUT4, Transcript of Proline permease, yeast

Gene PUT4, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUT4	YOR348C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ERD1	P16151	362 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YCR100C	P25606	316 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	HYM1	P32464	399 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YBR242W	P38331	238 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SPT20	P50875	604 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YKR011C	Q02209	353 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	TDA1	Q03533	586 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ENV7	Q12003	364 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MDM32	Q12171	622 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MPD2	Q99316	277 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MDM35	O60200	86 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YOL162W	P0CF19	215 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	DIT1	P21623	536 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SLY41	P22215	453 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	THI4	P32318	326 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PAM16	P42949	149 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	TPO4	Q12256	659 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SFG1	Q12507	346 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	LAG2	Q92325	660 aa		13.19	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	NPR1	P22211	790 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	CHL4	P38907	458 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	HPA3	P39979	161 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YDL176W	Q12027	708 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YOL114C	Q12322	202 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		13.18	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	HMG1	P12683	1054 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	CBS1	P14066	229 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RPB5	P20434	215 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	OMA1	P36163	345 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YEL068C	P39977	110 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YIL165C	P40446	119 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ELP4	Q02884	456 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YML096W	Q04489	525 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	XYL2	Q07993	356 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	CRT10	Q08226	957 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	FDH1	Q08911	376 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		13.17	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	FLP1	P03870	423 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PUP1	P25043	261 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	JEN1	P36035	616 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	CIN1	P40987	1014 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ATH1	P48016	1211 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PGA1	P53896	198 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PLB2	Q03674	706 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	IPK1	Q06667	281 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	SNC1	P31109	117 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ORC2	P32833	620 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YJL049W	P47048	450 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	COS10	P52924	374 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	NUP116	Q02630	1113 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	TPO3	Q06451	622 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MRPL35	Q06678	367 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	BAG7	Q12128	409 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		13.16	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PET54	P10834	293 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PET112	P33893	541 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	MTC2	P34246	357 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	ECM34	P38728	170 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YDR541C	Q03049	344 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	PLM2	Q04383	521 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	YOR019W	Q99248	730 aa		13.15	□□□□□ -0.3
PUT4	YOR348C	AHC2	P25649	128 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	SSH4	P32343	579 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	YKL097C	P34245	136 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	MCM7	P38132	845 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	ALP1	P38971	573 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	AAD14	P42884	376 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	TIM54	P47045	478 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	YPL113C	Q02961	396 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	ZIM17	P42844	174 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	FHN1	P53279	174 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	MMP1	Q12372	583 aa		13.14	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	FPS1	P23900	669 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	YCR102C	P25608	368 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	BUB3	P26449	341 aa		13.13	□□□□□ -0.31
PUT4	YOR348C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.13	□□□□□ -0.31	not detected

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