RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	SOD2	P00447	233 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SIR3	P06701	978 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NFT1	P0CE68	1218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	KIN3	P22209	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARO7	P32178	256 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	STP2	P38704	541 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARN2	P38724	620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SSU1	P41930	458 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	COX18	P53239	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CIK1	Q01649	594 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YMD8	Q03697	442 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YLR036C	Q07986	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RCN2	Q12044	265 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MED2	Q12124	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NMD4	Q12129	218 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RBD2	Q12270	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TRP4	P07285	380 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MER1	P16523	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YSR3	P23501	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ACH1	P32316	526 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	PMT1	P33775	817 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	LST4	P34239	828 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	HCS1	P34243	683 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	IFA38	P38286	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	JLP2	P40206	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NDE1	P40215	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	HMS2	P47175	358 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GPI8	P49018	411 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	NBP35	P52920	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	FLC3	P53121	802 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SGF73	P53165	657 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	GOR1	P53839	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ACS1	Q01574	713 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	MSC1	Q03104	513 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CCE1	Q03702	353 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SWF1	Q04629	336 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	SPO77	Q06134	477 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	ARR3	Q06598	404 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	TRM8	Q12009	286 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TRS33	YOR115C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GCN3	P14741	305 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GIT1	P25346	518 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YIM1	P28625	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
TRS33	YOR115C	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SSO1	P32867	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	SLC1	P33333	303 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RCN1	P36054	211 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GPX2	P38143	162 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MUM2	P38236	366 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TAE1	P38340	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MED6	P38782	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GGC1	P38988	300 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MIT1	P40002	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	LRO1	P40345	661 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YGR168C	P53293	376 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	CPR8	P53728	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ZRG17	P53735	605 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	NEJ1	Q06148	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YFT2	Q06676	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ATG10	Q07879	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	RRT8	Q08219	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	DCI1	Q08558	271 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	ATG29	Q12092	213 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	NFI1	Q12216	726 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MET2	P08465	486 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	VPS33	P20795	691 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	DCG1	P32460	244 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	MKK1	P32490	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TRS33	YOR115C	YHK8	P38776	514 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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