RNA–Protein interactions for RNA: YMR032W

HOF1, Transcript of SH3 domain-containing protein required for cytokinesis, yeast

Gene HOF1, Length 2,010 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HOF1	YMR032W	ANS1	P38832	159 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SHC1	P39000	512 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	FRT2	P39734	528 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	APS3	P47064	194 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YJR154W	P47181	346 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RUP1	Q12242	671 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RGS2	Q99188	309 aa		4.84	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	FZO1	P38297	855 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YER184C	P39961	794 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YER079W	P40052	210 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IRC24	P40580	263 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YGL204C	P53089	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YTP1	P53584	459 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SLD5	Q03406	294 aa		4.83	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	LAC1	P28496	418 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	IKI1	P38874	309 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	VRG4	P40107	337 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CIN5	P40917	295 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SAS2	P40963	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	GND2	P53319	492 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ATG4	P53867	494 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ORM2	Q06144	216 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NDE2	Q07500	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TMS1	Q12116	473 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CHO1	P08456	276 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PUT1	P09368	476 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TRM5	P38793	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	UBC11	P52492	156 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YGL235W	P53071	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RSM23	Q01163	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RSA1	Q08932	381 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MLH3	Q12083	715 aa		4.82	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CTR86	P25355	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	POP5	P28005	173 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RAD24	P32641	659 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	HAT2	P39984	401 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PRM10	P42946	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	AIM24	P47127	394 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NAS6	P50086	228 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RCF2	P53721	224 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NUP53	Q03790	475 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CAC2	Q04199	468 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NAT4	Q04751	285 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ASR1	Q06834	288 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ALE1	Q08548	619 aa		4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SWI1	P09547	1314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SIR3	P06701	978 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PPZ2	P33329	710 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ECM8	P38246	354 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	ATG7	P38862	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PHB1	P40961	287 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SSN8	P47821	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	UBP8	P50102	471 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	VEL1	P53058	206 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YPR003C	P53394	754 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SED5	Q01590	340 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	DLT1	Q04216	342 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YML053C	Q04978	212 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	PLB3	Q08108	686 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	THP1	Q08231	455 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	NAM2	P11325	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MCH2	P36032	473 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	OPY1	P38271	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SYG1	P40528	902 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	MUP1	P50276	574 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YLR460C	P54007	376 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	SNO1	Q03144	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
HOF1	YMR032W	YDR132C	Q03900	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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