RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	ECM25	P32525	599 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	GSP1	P32835	219 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	GSP2	P32836	220 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	AIM29	P36154	155 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	GPX2	P38143	162 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	FUI1	P38196	639 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	MMS4	P38257	691 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RRT2	P38332	387 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	HIS2	P38635	335 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YHK8	P38776	514 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	BZZ1	P38822	633 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	IKI1	P38874	309 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	PRM9	P39551	298 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	VAB2	P40003	282 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RGI1	P40043	161 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SWM2	P40342	146 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	LTP1	P40347	161 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	TIR3	P40552	269 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	CFD1	P40558	293 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YIR035C	P40579	254 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SER2	P42941	309 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YJL107C	P42947	387 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SAE2	P46946	345 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	PMT4	P46971	762 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	MOG1	P47123	218 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	PAC10	P48363	199 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	CLD1	P53264	445 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	TGL2	P54857	326 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YPL107W	Q02873	248 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	PRM15	Q03262	622 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RMT2	Q03305	412 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YDR286C	Q05530	114 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	VID22	Q05934	901 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YLR173W	Q06247	608 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SNA4	Q07549	140 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	YOL019W	Q08157	551 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	THI20	Q08224	551 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	NSL1	Q12143	216 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	MDM32	Q12171	622 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	MED1	Q12321	566 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	TRM10	Q12400	293 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	GIS3	Q12418	502 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	SAS5	Q99314	248 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	FLO11	P08640	1367 aa		3.22	□□□□□ -1.89
ECO1	YFR027W	CDC7	P06243	507 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MSS18	P08593	268 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	AQY1	P0CD91	305 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SNF3	P10870	884 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	BAR1	P12630	587 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SIR1	P21691	654 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	CSM1	P25651	190 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	LDS1	P31379	325 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SRB6	P32570	121 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	VPS17	P32913	551 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SPO23	P33757	523 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	TGL1	P34163	548 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	RRN10	P38204	145 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MBA1	P38300	278 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	ERG7	P38604	731 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	NSG1	P38837	291 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	VPS45	P38932	577 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	FLC2	P39719	783 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	HIS6	P40545	261 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	IDP2	P41939	412 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YGR201C	P42936	225 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	IRC8	P47046	822 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	UFD1	P53044	361 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	HCH1	P53834	153 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YNL092W	P53934	400 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MTQ1	P53944	314 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YNL034W	P53963	612 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SMA1	Q02651	245 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	OST6	Q03723	332 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	TVP15	Q03860	143 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	MFB1	Q04922	465 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	YOL075C	Q08234	1294 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	ESA1	Q08649	445 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	CSM4	Q08955	156 aa		3.21	□□□□□ -1.9
ECO1	YFR027W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9

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