RNA–Protein interactions for RNA: YER102W

RPS8B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS8B, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS8B	YER102W	RHB1	P25378	209 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YCR061W	P25639	631 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SEC17	P32602	292 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SPO23	P33757	523 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	NUF2	P33895	451 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	MTH1	P35198	433 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SOL2	P37262	315 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ARA1	P38115	344 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ARN2	P38724	620 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ATG7	P38862	630 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YEL020C	P39994	560 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	HEM14	P40012	539 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SPO73	P40031	143 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	JHD1	P40034	492 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	FCY21	P40039	528 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	JLP2	P40206	208 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YIR016W	P40572	265 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.35	□□□□□ -1.87	not detected
RPS8B	YER102W	GLG2	P47011	380 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	EFM3	P47163	339 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YJR149W	P47177	404 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	MDM34	P53083	459 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YNL140C	P53910	189 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	CIK1	Q01649	594 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SMA1	Q02651	245 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	MET31	Q03081	177 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	GRX3	Q03835	250 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SEG1	Q04279	960 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	NEJ1	Q06148	342 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	GRS2	Q06817	618 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	MDM36	Q06820	579 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	CRT10	Q08226	957 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	MED2	Q12124	431 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	NMD4	Q12129	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	PER33	Q12144	273 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YLR422W	Q06409	1932 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	RPN13	O13563	156 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	AAC1	P04710	309 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	NFT1	P0CE68	1218 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	PET122	P10355	254 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	GCN3	P14741	305 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	EPT1	P22140	391 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	GIT1	P25346	518 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	IML3	P38265	245 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	AXL2	P38928	823 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	UME6	P39001	836 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	COG3	P40094	801 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	PSA1	P41940	361 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YJL043W	P47053	257 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YJR030C	P47101	745 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	PRM8	P53174	237 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SWC4	P53201	476 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ORM1	P53224	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	ZRG17	P53735	605 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YNL181W	P53878	407 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	RCF1	Q03713	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	KRE28	Q04431	385 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YLR345W	Q06137	509 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	YPR011C	Q12251	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SFM1	Q12314	213 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	GLE1	Q12315	538 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	SRN2	Q99176	213 aa		3.34	□□□□□ -1.87
RPS8B	YER102W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	MSF1	P08425	469 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	TFS1	P14306	219 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	POL30	P15873	258 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	RER1	P25560	188 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	ATP11	P32453	318 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	MEI5	P32489	222 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	SLC1	P33333	303 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	PXA2	P34230	853 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	GGC1	P38988	300 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.33	□□□□□ -1.88	not detected
RPS8B	YER102W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	MIT1	P40002	666 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	NDE1	P40215	560 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	SOK1	P40317	901 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	LAS21	P40367	830 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	YFR018C	P43599	363 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RPS8B	YER102W	HOC1	P47124	396 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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