RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C SWM1Q12379 170 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PCD1Q12524 340 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C COA6Q3E846 104 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RIB3Q99258 208 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ISN1Q99312 450 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C FLO11P08640 1367 aa3.01□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SPS2P08459 502 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SRD1P09007 221 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ATP5P09457 212 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ERG11P10614 530 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C BAR1P12630 587 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C FRS1P15624 595 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C DBR1P24309 405 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PEX4P29340 183 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C DGR2P32330 852 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SPO23P33757 523 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C TVP38P36164 337 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PDX3P38075 228 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C AME1P38313 324 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C LRP1P38801 184 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CYC2P38909 366 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MLH1P38920 769 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SEC72P39742 193 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SWM2P40342 146 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RFC2P40348 353 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SDP1P40479 209 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C URM1P40554 99 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CAF16P43569 289 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CHA4P43634 648 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MOG1P47123 218 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C LYS20P48570 428 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PIB2P53191 635 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YDR248CQ03786 193 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ATC1Q04005 294 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C LDB18Q07887 179 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C HRD1Q08109 551 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RRG1Q12167 365 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YDR018CQ12185 396 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C INP53Q12271 1107 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C TRM10Q12400 293 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SPE4Q12455 300 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RHO2P06781 192 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C QCR2P07257 368 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C DST1P07273 309 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C TRP4P07285 380 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CDC6P09119 513 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SPO16P17122 198 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RNP1P32385 249 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SRB6P32570 121 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YIL089WP40500 205 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C HIS6P40545 261 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C HXT14P42833 540 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SSY5P47002 699 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YGL101WP53144 215 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RPN14P53196 417 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ALG11P53954 548 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ELP3Q02908 557 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CTS2Q06350 511 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C GUP2Q08929 609 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MDM32Q12171 622 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C NPC2Q12408 173 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C HSH49Q99181 213 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SAS5Q99314 248 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YIL177CP40434 1758 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YJL225CP40889 1758 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SNF3P10870 884 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C BUB3P26449 341 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C ERG1P32476 496 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MDL1P33310 695 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SOF1P33750 489 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MBA1P38300 278 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C FMO1P38866 432 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C IMA5P40884 581 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C NPY1P53164 384 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CPR8P53728 308 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YML096WQ04489 525 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YLR297WQ05899 129 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RRT8Q08219 342 aa3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YDL085C-AQ3E7B7 68 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C TPK1P06244 397 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C RHO1P06780 209 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C NUC1P08466 329 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C DAL82P21705 255 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C KIN82P25341 720 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C AHC2P25649 128 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C COT1P32798 439 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C MRPL4P36517 319 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C AGP2P38090 596 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CTP1P38152 299 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C SRO77P38163 1010 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C YHK8P38776 514 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C IPI1P38803 334 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C PFS1P38872 237 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C CTF8P38877 133 aa2.99□□□□□ -1.93
DOA4YDR069C GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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