RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464283.5

CTPS1-205, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-205ENST00000464283 TRPC6Q9Y210 931 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TRANK1O15050 2925 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 KAT6AQ92794 2004 aa6.01□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 VWA3AA6NCI4 1184 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PRR23AA6NEV1 266 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 MAFGO15525 162 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 KINO60870 393 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PPFIA4O75335 1185 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FGBP02675 491 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LGALS2P05162 132 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ACTN1P12814 892 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ICAM3P32942 547 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 RFC2P35250 354 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 UBA7P41226 1012 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 NBL1P41271 181 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TXKP42681 527 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SP2Q02086 613 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PDIA5Q14554 519 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PRR16Q569H4 304 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 KANK3Q6NY19 840 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF365Q70YC5 407 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LRRC8DQ7L1W4 858 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CYFIP1Q7L576 1253 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 OTOP2Q7RTS6 562 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ASCL5Q7RTU5 278 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 DEFB128Q7Z7B8 93 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PLA2G4DQ86XP0 818 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FSIP1Q8NA03 581 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CAGE1Q8TC20 777 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 EDAQ92838 391 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GPRASP2Q96D09 838 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CHAMP1Q96JM3 812 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 AK8Q96MA6 479 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FAM20AQ96MK3 541 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PCDHA12Q9UN75 941 aa6□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LCTP09848 1927 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 WDR81Q562E7 1941 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 C17orf102A2RUQ5 167 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 H3BRB1 525 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 HAS3O00219 553 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ADAMTS3O15072 1205 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SLC26A4O43511 780 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TDP2O95551 362 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SELPP16109 830 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ITGB5P18084 799 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 IRS1P35568 1242 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TECP42680 631 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SYKP43405 635 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SEMA3FQ13275 785 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 PTK7Q13308 1070 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 KRT79Q5XKE5 535 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 HAUS3Q68CZ6 603 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 NIPA1Q7RTP0 329 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TRIM50Q86XT4 487 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CALML4Q96GE6 196 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 CLIC6Q96NY7 704 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 GPR20Q99678 358 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SENP7Q9BQF6 1050 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 MXRA8Q9BRK3 442 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SDF4Q9BRK5 362 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 ZNF577Q9BSK1 485 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 JADE2Q9NQC1 790 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 TBC1D22BQ9NU19 505 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 HDAC6Q9UBN7 1215 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 LRWD1Q9UFC0 647 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 USP25Q9UHP3 1055 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 KCNH3Q9ULD8 1083 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FAM50BQ9Y247 325 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 A0A1B0GVL5 298 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 FAM86B1E9PN63 330 aa5.98□□□□□ -1.45
CTPS1-205ENST00000464283 MEIS1O00470 390 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms