RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C NFI1Q12216 726 aa1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C HTZ1Q12692 134 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SCH9P11792 824 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SPT10P35208 640 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C LAS1P36146 502 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C ADH5P38113 351 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PTI1P39927 425 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C OXA1P39952 402 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CLD1P53264 445 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MFG1Q07684 458 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CMS1Q07897 291 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C FCY22Q12119 530 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C NAG1Q8TGN9 163 aa1.51□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C UBA1P22515 1024 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C AAT2P23542 418 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PHO84P25297 587 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PRR1P28708 518 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PSO2P30620 661 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C FAA1P30624 700 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C VPH1P32563 840 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YBL028CP38202 106 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C BAT1P38891 393 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YNL208WP40159 199 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C ATG18P43601 500 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PEX27Q08580 376 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PCL9Q12477 304 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data1.5□□□□□ -2.17not detected
HDA3YPR179C ANR2P36090 516 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SEC27P41811 889 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YNR068CP53754 272 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YET2Q04210 160 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C LIP2Q06005 328 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YDL114WQ07530 308 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C GAT3Q07928 141 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YDL199CQ12407 687 aa1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MRPL8P22353 238 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C FUN26P31381 517 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MSK1P32048 576 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SPO23P33757 523 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C LYS12P40495 371 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DFG10P40526 253 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SNL1P40548 159 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RET3P53600 189 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C UTP6Q02354 440 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YPR078CQ06813 372 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SFG1Q12507 346 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YOR338WQ99326 363 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SPT7P35177 1332 aa1.49□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C DBR1P24309 405 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RDS1P25611 832 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CDC50P25656 391 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PTK1P36002 662 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SIF2P38262 535 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YER186CP40101 306 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPA34P47006 233 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MPS2P53159 387 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YNL143CP53908 130 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C REX2P54964 269 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SKI8Q02793 397 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C AIM33Q04516 312 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SHS1Q07657 551 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YOR012WQ12351 137 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C FSH3Q99369 266 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C OPI1P21957 404 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C EFB1P32471 206 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C OM14P38325 134 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PFS1P38872 237 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TIM17P39515 158 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SEC9P40357 651 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CIN2P46670 268 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CTK3P46963 296 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YMR010WQ03687 405 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YHC1Q05900 231 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YLH47Q06493 454 aa1.48□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C STE3P06783 470 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPS16AP0CX51 143 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPS16BP0CX52 143 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C MAS2P11914 482 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C THR4P16120 514 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C ZRC1P20107 442 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CHA1P25379 360 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SSE1P32589 693 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C IES6P32617 166 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C VAM7P32912 316 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CAJ1P39101 391 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C SEO1P39709 593 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C LCP5P40079 357 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C KEG1P43614 200 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C AIP1P46680 615 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C TRF5P48561 642 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C CUE3P53137 624 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YGR016WP53209 190 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C AQR1P53943 586 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C YDR286CQ05530 114 aa1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C PML1Q07930 204 aaPredicted RBP1.47□□□□□ -2.17
HDA3YPR179C NBL1Q3E7Y6 73 aa1.47□□□□□ -2.17
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